Amanda Tovar
Microbio sintético, la cantidad de genes más pequeña que pueda existir,
pero muchos misterios por resolver
En el siguiente ensayo hablaremos acerca de
una bacteria recientemente descubierta que creció dentro de una caja de Petri
en un laboratorio de California, es un hecho realmente sorprendente ya que el
organismo apenas descubierto está considerado fuera de los límites que se deben
cumplir para sobrevivir y reproducirse contando con 473 genes solamente
Esta nueva estructura ha despertado un gran
interés en los biólogos evolucionistas y biotecnólogos, quienes ya han empezado
a agregarle genes, uno por uno para estudiar sus efectos, ya que mencionan que
es un paso importante crear una célula viva donde el genoma está completamente
definido. Pero muchos otros mencionan que esto es inútil ya que un tercio de
los genes de este permanece desconocido.
La nueva bacteria (Syn 3.0) como su nombre
lo indica, no fue el primer intento de vida sintética, se había antes
sintetizado cromosoma de mycoplasma
mycoides, una bacteria con un genoma relativamente chico, y se había trasplantado
a un mycoplasma separado, llamado M.
Capricolum, al que previamente se le había extraído ADN y después de varios
falsos intentos, se demostró que el organismo sintético comenzó a sintetizar
proteínas normalmente sintetizadas solamente por la M. mycoides.
Los científicos trataron con otra tarea,
haciendo uso de todo su conocimiento genómico, diseñar el cromosoma de un
bacteria con el genoma mínimo hipotético, pero al final se llegó a la
conclusión de que ni si quiera el cromosoma pudo producir un microbio vivo, esto
solo significa que el conocimiento que tenemos acerca de la biología no es
suficiente para diseñar un organismo vivo y construirlo
De igual modo dividieron el genoma del Syn
1.0 (que contiene 901 genes) en ocho
secciones añadiendo fragmentos idénticos de ADN de principio a fin, lo que les
permitió tratar las secciones como módulos independientes y si se alteraba el
genoma podían darse cuenta de que el fragmento no era viable y se tenía que
restaurar el gen.
Esto les permitió organizar de una forma
sistematizada a ciertos genes, agrupándolos por características en común, este
trabajo resulta de gran utilidad ya que podrá facilitarles trabajo a los
futuros biólogos sintetistas que trabajen con Syn 3.0
Por lo tanto podemos llegar a la conclusión
de que con un total de 531000 bases, por ahora, la bacteria Syn 3.0 es el
microbio con menor cantidad de genes en el planeta.
calificación
Bien
SABINA YETLANEZI SÁNCHEZ OLIVERA
ReplyDeletePuede que tengamos el genoma humano completamente secuenciado, sin embargo, nuestro conocimiento acerca de los genes y su función es muy limitada, es por eso que se han intentado varias cosas con el fin de conocer cuál es su función y cuáles son genes vitales o basura.
En uno de estos intentos por conocer la función e importancia de cada gen así como descubrir la cantidad mínima de genes vitales, se creó la bacteria con el genoma más pequeño del mundo en la universidad de California. Para poder crear este organismo biosintético con el genoma más pequeño, se necesitó de varios intentos. Inicialmente se sintetizó el único cromosoma de la bacteria mycoplasma mycoides, la cual tiene un genoma relativamente pequeño, y posteriormente se insertó su genoma en otra bacteria de la cual habían removido el DNA con anterioridad, finalmente tras varios intentos, la bacteria en la que habían insertado el genoma de la mycoplasma mycoides comenzó a sintetizar proteínas de m.m., en lugar de sintetizar sus propias proteínas. Una vez completado este logro, los mismos investigadores quisieron reducir el genoma lo más posible, es decir, que el genoma tuviera únicamente los genes vitales, con base en los conocimientos existentes sobre genómica, sin embargo, a pesar del esfuerzo, no se pudo crear un organismo vivo, por lo que estos investigadores se dieron cuenta del poco conocimiento que tenemos acerca de los genes y cuáles son los esenciales para crear vida, por lo que decidieron cambiar de técnica. En este nuevo intento por reducir el genoma, dividieron el genoma de m.m. en secciones, posteriormente comenzaron a remover genes con el fin de saber si eran vitales o no ;si el DNA "nuevo" ya sin algún gen que habían retirado previamente no producía un organismo vivo o el organismo dejaba de funcionar adecuadamente, era señal de que habían removido un gen vital, así que lo volvían a insertar, si por el contrario, el gen que retiraban permitía que la bacteria se desarrollara adecuadamente, significaba que no era un gen vital, por lo que puede que se tratara de un gen "basura" ya que no codifica para nada .
Fue así como redujeron el genoma original de m.m. A tan solo la mitad de su tamaño original, creando así el organismo con el genoma más pequeño del mundo, sin embargo, se desconoce la función de al menos un tercio de los genes, por lo que el nuevo reto es insertar uno a uno los genes y observar sus efectos para poder determinar su función .
Todos estos estudios son importantes para conocer "el secreto de la vida" actualmente y para crear vida biosintética con genomas constituidos por genes 100% vitales, lo cual me parece extraordinario, ya que el conocimiento nos enriquece, sin embargo, me preocupa que una vez que tengamos esta información la usemos de forma incorrecta, como hemos hecho con casi todo, y sin pensar en los efectos que podrían tener a largo plazo algunas de sus aplicaciones .
Bien!!
DeleteMonroy Guzmán Camila
ReplyDeleteValeria Souza
Jueves 25 agosto 2016.
Synthetic microbe has fewest genes but many misteries.
One-third of 473 genes in microbe have unknown functions
En el artículo se desarrolla la investigación, principalmente, de Craig Venter y su equipo de investigación (Venter Institute) que ha trabajado en diseñar a bacterial chromosome with the hypothethical minimium genome y desarrollar vida sintética desde el 2010. Inició con un proyecto en conjunto con Clyde Hutchison buscando crear una bacteria que pudiera sobrevivir con minimal set of genes needed for life, también se describe los experimentos e intentos que han hecho y cómo los han hecho y cuáles resultados han obtenido. El resultado más importante y el central del artículo es el Syn 3.0, que marca a new lightweight record-holder con sólo 473 genomas, capaz de duplicarse en 3 horas y de sintetizar proteínas del cual al menos 149 genomas permanecen sin conocerse, la importancia de este microbio sintético radica en el uso de todos los conocimientos que se tienen de los genomas, microbios y cromosomas y cómo a través de estos se puede crear un ser vivo a nivel microscópico.
En el 2010, el equipo de Venter reportó que había logrado sintetizar el cromosoma de Mycoplasma mycoides y lo añadieron a un micoplasma del cual previamente fue sustraído el DNA, con lo que obtuvieron un microbio sintético capaz de sintetizar proteínas, al cual nombraron Syn 1.0; a partir del Syn 1.0 se dieron a la tarea de diseñar otro microbio sintético que constara de únicamente los genomas necesarios para vivir, ya que éste constaba de al menos 900.
El Syn 1.0 constaba de 901 genomas los cuales dividieron en 8 secciones y al principio y al final de cada una insertaron DNA idénticos, tomaron cada sección como módulo independientes, removing each one in turn, deleting chunks of DNA, then reassembling the full genome and reinserting it into M. capricolum to see whether it produced a living cell. Para llegar al Syn 3.0, hubo una etapa de transición (Syn 2.0) en la que fueron eliminando genomas innecesarios o duplicando los más necesarios buscando disminuir el número de genomas que conformarían el microbio. Así pasaron de 900 genomas, a un poco más de 500 (Syn 2.0) para llegar a 473 (Syn 3.0)
La creación de vida sintética a nivel microscópico es definitivamente un reto científico criticable desde muchas vertientes, desde el proceso que se siguió para llegar al Syn 3.0 y lo que significa haber llegado para el avance científico, me parece que es un momento determinante para el camino de la biología.
El artículo toca varios temas, desde la escala de la flor japonesa y cuál es el nuevo campo de ésta (Syn 3.0) hasta, la que me pareció más interesante, el proceso que se llevó acabo para crear a Syn 3.0, un proceso largo y, como lo dice Venter, sorprendentemente se falló porque los conocimientos no eran suficientes, lo que es un reflejo de las investigaciones y experimentaciones científicas y hasta el espíritu mismo del científico, el repensar, investigar, indagar, experimentar hasta el último resultado.
Me gustó el artículo por el tema que trata ya que es muy interesante y no había leído mucho de esto antes, también por el proceso que describe y la experiencia de los científicos involucrados en el proceso.
Bibliografía.
Robert F. Service , 2016, Synthetic microbe has fewest genes, but many
mysteries. Science: 351, 6280, pp 1380
Bien!
DeleteFranco Flores Emmanuel
ReplyDeleteEnsayo de “microbio sintético tiene menor cantidad genes, pero muchos misterios”
En el mundo actual hay distintos pesos en lo que respecta al genoma, el peso pesado en esta categoría es actualmente una flor japonesa rara llamada Paris japónica que cuenta con 50 veces más DNA que el humano, y del otro lado, en peso ligero, el actual campeón es Syn3.0 con un genoma más pequeño que M. genitalium.
Syn3.0 no es la primera forma de vida sintética que se crea. Syn1.0 fue el primer organismo sintético, por decirlo así, habían sintetizado el único cromosoma de la bacteria Mycoplasma mycoides con un genoma relativamente pequeño y trasplantado en un micoplasma separado llamado M. capricolum, de la que habían extraído previamente el ADN. Después de varios intentos fallidos, se demostró que el microbio sintético inició proteínas normalmente producidas por M. mycoides en lugar de M. capricolum.
Después de Syn1.0, decidieron crear un nuevo organismo con el mínimo número de genes con el que pudiera subsistir, el diseño fue hipotético y el experimento fallo, así que decidieron hacer un prueba y error dividiendo y eliminando sesiones del DNA de Syn1.0, con 901 genes, e insertando en M. capricolum y si el genoma no era viable, la sección eliminada era esencial para la vida.
Esto les permitió reducir considerablemente el número de genes, eliminando los no esenciales o los que duplicaban la función de otro. Realizaron cientos de construcciones, diseños y pruebas de microbios hasta llegar a Syn3.0 (Syn2.0 fue una etapa intermedia en el proyecto y fue el primero en tener una menor cantidad de genes que M. genitalium con 525 genes).
Aunque el equipo de Craig Venter ha diseñado este organismo que contiene casi la mitad de genes que Syn1.0 con los genes esenciales para que esté vivo, desconocen la función de 149 genes de los 473 que conforman el genoma de Syn3.0.
Sinceramente este trabajo es impresionante una forma de vida con la información vital es un gran avance biotecnológico, aunque como ya se mencionó aproximadamente treinta por ciento del genoma esencial tiene funciones desconocidas. Este trabajo servirá para tener una idea de cómo era el primer organismo bacteriano del planeta y así tener un mejor enfoque de cómo se inició la vida sobre este mundo.
bien!
DeleteThis comment has been removed by the author.
ReplyDeleteAnya Miranda Reyes Torres
ReplyDeletePrimero por lado, se encontró una flor japonesa que tiene 50 veces más ADN que los humanos pero también hay una bacteria con el genoma más pequeño y los genes de menor cantidad que se pueden encontrar en un organismo. Se conoce a este pequeño organismo como Syn 3.0 y tiene la cantidad de genes estrictamente necesarios para sobrevivir y reproducirse, 473 genes; los humanos tenemos entre 20,000 y 25,000 genes. El Syn 3.0 no es la primera forma de vida sintética que crea el científico Venter. En 2010, su equipo informó que habían sintetizado el único cromosoma de Mycoplasma mycoides -que es un microbio que vive en el ganado-de una bacteria con un genoma pequeño y trasplantado en un micoplasma separado llamado M. capricolum, a la que le habían quitado previamente el ADN. Habían creído que el número mínimo de genes que se requerían para crear vida era de 300 genes, pero con este experimento se dieron cuenta que obviamente se necesitaban más. De acuerdo con los análisis de ADN, las medusas peine evolucionaron antes que los otros animales ( Algunos estudios dicen que las esponjas surgieron primero). Una posibilidad es que las medusas peine evolucionaron a través de los poros por su cuenta propia. Browne está investigando la teoría de que las medusas peine activan los mismos genes a la hora de desarrollar sus poros.Venter dijo que " nuestro conocimiento actual de la biología no es suficiente para sentarse, diseñar y construir un organismo vivo”. Venter y su equipo tuvieron éxito con ensayo y error. Se dividieron el genoma de Syn 1.0, con sus 901 genes en ocho secciones . Para el comienzo y el final de cada sección le añadieron etiquetas de ADN idénticas y eso hizo que las piezas fueran fáciles de juntar. Eso les permitió tratar las secciones como secciones independientes y la eliminación de cada uno y volver a montar el genoma completo y volver a insertar en M. Capricolum para ver si se producía una célula viva. Si el genoma alterado no era viable, sabían que habían cortado un gen esencial que tenían que restaurar. El equipo de Venter construyó, diseñó y probó "cientos" de múltiples construcciones antes de decidirse por Syn 3.0, con un genoma de la mitad del tamaño de Syn 1,0 de. (Syn 2.0 era una etapa intermedia en este proceso, el primer microbio con un genoma más pequeño que el de M. genitalium, que con 525 genes tiene la menor cantidad que cualquier organismo natural). Con un total de 531.000 bases, el nuevo organismo de genoma no es mucho menor que la de M. genitalium, con 600.000 bases. Pero M. genitalium crece muy lento, tanto que una población de células puede tomar semanas para duplicarse. Syn 3.0, por el contrario, tiene un tiempo de duplicación de 3 horas."No estamos diciendo este es el genoma es el final " sin embargo, Syn 3.0 es el organismo con menos genes del mundo.
Me sorprendió bastante la idea de que crearan una bacteria que tiene tan poco genes, digo, en comparación a los que tenemos nosotros son muy pocos. Creo que esta tecnología puede tener muchas aplicaciones. Prácticamente lo que hicieron fue quitar y poner, a veces veían que algunos genes no eran necesarios pero otros lo eran, y mucho; fue como un ensayo y error, uno que los llevó a crear un microbio con muy pocos genes. Es un organismo que, como lo menciona el artículo puede tener el secreto para entender la vida-un tema de gran importancia y que nadie ha podido explicar perfectamente-Lo que yo sabía de los genes era que le decían a tu cuerpo cómo producir ciertas proteínas-como las medusas y su fluorescencia- y que teníamos más de 20,000 genes en cada una de nuestras células; y me podía, hasta cierto punto, imaginar la magnitud de lo que esto significaba pero jamás pasó por mi mente el hecho de que se pudiera crear un organismo como este. Y a pesar de que hayan hecho esto, ahora falta descubrir para qué sirven o qué papel juegan esos 149 genes desconocidos.
bien!
DeleteMARÍA JOSÉ BELMONT GARCÍA
ReplyDeleteEste artículo nos habla sobre Syn 3.0 un organismo creado en un laboratorio que posee el genoma más pequeño en la historia. Para acercarnos a los asombroso que es este logro el artículo menciona la flor Paris japonica que se lleva el genoma más grande, el cuál es 50 veces más grande que el genoma humano.
Una vez situada esta relación es increíble el hecho de que pueda existir un microbio con sólo 473 genes en su genoma, al cual se pudo llegar después de varios intentos en los que se fue seccionando el genoma de diferentes maneras hasta que esta resultó. Pero este logró no fue tan fácil como parece ya que en inicio e incluso al finalizar este proyecto no se conocía cuales eran las funciones especificas de cada gen, lo que llevo al equipo de J. Craig Venter a enfrentarse a una labor bastante difícil ya que hubo varios intentos en los que el genoma seleccionado no tenía la secuencia de genes necesarias para producir un organismo viable como se quería lograr, fue por esta razón que llegar al Syn 3.0 constituyo una serie de intentos y errores.
Finalmente cuando se logró producir una célula viva, los investigadores realizaron una clasificación de los genes en cuanto a los que trabajaban en las vías más comunes, este hecho ayuda y ayudará a futuro a los biólogos sintéticos. Otra característica esencial de Syn 3.0 es que se reproduce con mayor velocidad que otro organismo con un genoma pequeño llamado M. genitalium, ya que se reproduce en solo tres horas a diferencia del anterior que lleva alrededor de dos semanas, esto juega un papel muy importante para su estudio ya que el factor del tiempo es esencial a la hora de este tipo es investigaciones.
El hecho de que hoy en día puedan existir tales proyectos con ideas tan ambiciosas en la bioingeniería o sorprendente, ya que nos abre un nuevo camino al futuro e cuanto a muchos aspectos. Pero lo que a mi parecer es lo más importante a resaltar es el hecho de que a pesar de que 473 genes fue el número más pequeño de genoma que se pudo lograr, no se conoce la función de cada gen, así como es el caso de diversos genomas, lo que nos lleva a lo siguiente, los conocimientos en biología aun no son suficientes, aun hace falta conocer cuáles son todas esas funciones de los genes que no se conocen, para poder utilizarlas en futuros avances de este tipo.
bien!
DeleteMARÍA JOSÉ BELMONT GARCÍA
ReplyDeleteEste artículo nos habla sobre Syn 3.0 un organismo creado en un laboratorio que posee el genoma más pequeño en la historia. Para acercarnos a los asombroso que es este logro el artículo menciona la flor Paris japonica que se lleva el genoma más grande, el cuál es 50 veces más grande que el genoma humano.
Una vez situada esta relación es increíble el hecho de que pueda existir un microbio con sólo 473 genes en su genoma, al cual se pudo llegar después de varios intentos en los que se fue seccionando el genoma de diferentes maneras hasta que esta resultó. Pero este logró no fue tan fácil como parece ya que en inicio e incluso al finalizar este proyecto no se conocía cuales eran las funciones especificas de cada gen, lo que llevo al equipo de J. Craig Venter a enfrentarse a una labor bastante difícil ya que hubo varios intentos en los que el genoma seleccionado no tenía la secuencia de genes necesarias para producir un organismo viable como se quería lograr, fue por esta razón que llegar al Syn 3.0 constituyo una serie de intentos y errores.
Finalmente cuando se logró producir una célula viva, los investigadores realizaron una clasificación de los genes en cuanto a los que trabajaban en las vías más comunes, este hecho ayuda y ayudará a futuro a los biólogos sintéticos. Otra característica esencial de Syn 3.0 es que se reproduce con mayor velocidad que otro organismo con un genoma pequeño llamado M. genitalium, ya que se reproduce en solo tres horas a diferencia del anterior que lleva alrededor de dos semanas, esto juega un papel muy importante para su estudio ya que el factor del tiempo es esencial a la hora de este tipo es investigaciones.
El hecho de que hoy en día puedan existir tales proyectos con ideas tan ambiciosas en la bioingeniería o sorprendente, ya que nos abre un nuevo camino al futuro e cuanto a muchos aspectos. Pero lo que a mi parecer es lo más importante a resaltar es el hecho de que a pesar de que 473 genes fue el número más pequeño de genoma que se pudo lograr, no se conoce la función de cada gen, así como es el caso de diversos genomas, lo que nos lleva a lo siguiente, los conocimientos en biología aun no son suficientes, aun hace falta conocer cuáles son todas esas funciones de los genes que no se conocen, para poder utilizarlas en futuros avances de este tipo.
López Velázquez Nadia Saray
ReplyDeleteUn gran punto en la creación de la vida sintética en el laboratorio es el tamaño del genoma, se ha comparado a un organismo por ejemplo, que presenta cincuenta veces más DNA que los humanos, se trata de una extraña flor japonesa. Pero en el otro extremo encontramos a un microorganismo cuyo estudio supondría grandes avances para la biotecnología. Investigadores de California en colaboración con Craig Venter fundador de “Synthetic genomics” se han propuesto crear lo que hoy en día es la bacteria con el genoma más pequeño y la mínima cantidad de genes posibles para un organismo con vida, con sus 473 genes se le permite poder sobrevivir y reproducirse de una manera funcional.
La importancia de este organismo es que abre las puertas a la creación de una célula con el genoma totalmente definido y por otro lado brinda la posibilidad de estudiar los efectos y funciones de genes específicos que nos hablen sobre la base de la vida misma desde el punto biológico.
Para llegar a esta bacteria se sintetizó el cromosoma de Mycoplasma micoides y se trasplantó a Mycoplasma capricolum a la cual se le había extraído el DNA. Después de varios intentos se descubrió que el microbio sintetizaba proteínas de M. Micoides y después de observar esto los investigadores regresaron el material genético a su organismo inicial.
El objetivo de Venter consiste en obtener el “genoma mínimo” eliminando los genes que no sean necesarios para la vida de Syn 1.0 (el modelo inicial). Esta vez en el diseño del cromosoma microbiano, los investigadores sintetizaron y trasplantaron en M. Capricolum para ver si producía un organismo adecuado. Sin embargo fallaron y fue necesario repetir el proceso una y otra vez hasta que obtuvieron el genoma Syn 1.0 con 901 genes en 8 secciones, está situación facilitó mucho las cosas al poder trabajar con cada una de las secciones e ir eliminando trozos de DNA para reducirlo y volver a armar el genoma completo e introducirlo en M. Capricolum y ver si ahora si genera una célula viva. Este proceso sirvió para identificar genes que no eran vitales y aquellos que si lo eran se identificaban interrumpiendo sus funciones introduciendo material extraño.
El paso por Syn 2.0 fue transitorio, una etapa intermedia en el proceso, pero lo importante de este microbio es que contaba con un genoma más pequeño que el de M. Genitalium que tiene el conjunto más pequeño de genes pero de manera natural. Al finalizar la reducción de los genes y su reordenación se llegó a Syn 3.0 con sus 473 genes y un desarrollo de duplicación en 3 horas.
Finalmente se puede decir que lo que ha logrado Venter junto a su equipo es la base para los siguientes estudios que se hagan con Syn 3.0, avances mismos que permitan incluso el diseñar organismos con propiedades específicas que provean de beneficios en las diferentes aplicaciones que se les dé y pueda ser aprovechado en la mayor medida posible tanto por la ciencia como por la industria.
bien!
DeleteMÉRIDA ESCUDERO KARLA DANIELA
ReplyDelete“SYNTHETIC BIOLOGY
Synthetic microbe has fewest genes, but many mysteries
One-third of 173 genes in microbe have unknown functions.”
Este es un artículo impresionante que nos informa sobre la creación de un microbio sintético llamado “el nuevo campeón de peso ligero” ya que este tiene la genoma más pequeño y el menor número que genes que cualquier otro organismo, es conocido como Syn 3.0 creada en el Instituto J. Craig Venter. Solamente cuenta con los genes necesarios para vivir y poder reproducirse. Los biólogos y biotecnólogos están completamente interesados por este caso; Chris Voigt, biólogo sintético dice que es un paso muy importante para la creación de una célula viva donde el genoma está totalmente definido.
Otra cosa muy interesante de este organismo es que se desconoce la funcione de una tercera parte de sus genes, lo principal que buscan hacer los investigadores es descubrir esto ya que pueden traer nuevos conocimientos sobre la biología básica de la vida.
Al parecer, fue creado por “ensayo y error” ya que no es la primera vida cinética hecha por Venter, (por ello el nombre de 3.0 Syn). Todo comenzó en el año 2010 cuando se informó que habían sintetizado el único cromosoma de una bacteria con un genoma muy pequeño, dicho cromosoma fue trasplantado a micoplasma llamado M. Carpicolum de la que previamente ya se tenía conocimiento de si ADN. Después de varios errores se logró que M. Carpicolum sintetizara. Posterior a esto los investigadores decidieron separar los genes de Syn 1.0 para poder estudiar más detalladamente y así poder ver cuáles eran los genes que se duplicaban y los que no eran esenciales, todo esto para llevar a cabo una eliminación de trozos de ADN. Y probar si al volver a juntar el genoma se produce una célula viva. Después de muchas pruebas, se hace el proceso para Syn 3.0 cuyo tamaño era la mitad del Syn 1.0. Sin embargo aún existe la duda sobre si es este el genoma mínimo final.
Son increíbles todos los avances que existen hoy en día, que el ser huma es capaz de crear organismos sintéticos para seguir respondiendo preguntas. Siempre existe la pregunta “¿por qué? O ¿cómo?” y lo más impactante es que los investigadores nunca paran hasta encontrar las respuestas o tratar de dar alguna explicación a los fenómenos como lo es la vida.
Tratar de imaginar el largo proceso para encontrar a Syn 3.0, las dudas, las ideas, los errores, y todo lo que implica el desarrollo de un proyecto como este es realmente impresionante.
bien!
DeleteSANCHEZ FUENTES ROCIO SARAHI
ReplyDeleteComo en el artículo se señala, los científicos comenzaron la creación de vida sintética a partir de conocimientos previos de los cromosomas y de la bacteria a realizar, cada uno de los organismos sintetizados produjo un genoma definido con cantidades pequeñas de ellos; lo que les permitió a los biólogos genetistas probar y experimentar con cada gen de la bacteria. Le quitaron genes de varios lugares, los reemplazaron, los aumentaron a su decisión para poder observar las reacciones ante los estímulos.
La bacteria serviría para crear materia viva a partir de varios genes presentes en ella o de su utilización completa, pero aun no se lograron descubrir todas las variables posibles del experimento por lo que se añadieron mas bacterias sintéticas al desarrollo científico. Se dio paso a la Syn 3.0 la cual cuenta con un genoma definido de 473 genes, pero se descubrió que requería de M. mycoides para poder sintetizar las proteínas de manera normal, por lo que no se dio la creación de un microbio vivo, este no podría ser integrado de una manera correcta a la vida, ya que los conocimientos actuales son muy básicos o indefinidos todavía.
Uno de los grandes problemas es el desconocimiento parcial de los cromosomas, debido a que sin un conocimiento total del cromosoma y/o las bacterias, no se puede llegar a replicar las bacterias y mucho menos llegar a formar vida a partir de ellas. Otro gran ejemplo es el del genoma Syn 1.0, igual modo este fue dividido, fragmentado y reconstruido para ver sus reacciones, pero se dieron cuenta de que el genoma no era conveniente y se tenía que restaurar al original para que pudiera mantenerse estable, por lo que de igual manera fue descartado para las experimentaciones futuras.
En mi opinión la ciencia está avanzando muy rápido cada día de manera descontrolada, está bien que se quieran resolver las dudas sobre la vida y su origen, pero no puede hacerse de una manera eficaz y correcta si no se ha llegado al conocimiento total de ellas. En vez de adelantarnos al querer formar vida, hay que pensar si realmente conocemos que es la vida o quedan dudas de ello en algunos puntos, seria ahí donde deberían hacerse estos experimentos para llenar los huecos; y ya a partir de allí surgir con nuevos experimentos y nuevas tecnologías q nos permitan realizar cada uno de ellos.
bien
DeleteKaren Lizbeth Claro Mendoza
ReplyDelete¿Estamos realmente cerca de conocer el verdadero significado y los principios fundamentales de la vida? ¿Qué se necesita para que se diseñe y construya un organismo viviente?
En el mes de marzo de este año, en la revista Science, Venert Craig reportó que se logró sintetizar al microrganismo Syn 3.0 la el cual es el organismo viviente con el genoma más corto, contiene sólo 473 genes.
Los biólogos evolucionistas y biotecnólogos vislumbran un futuro prometedor para investigar la función de los genes añadiendo al corto genoma, gen por gen y estudiar sus efectos. Pero es importante recalcar que aproximadamente un tercio de los 473 genes (149 genes) no se conocen completamente.
Considero que conocer los principios, genes, fenómenos y demás, que permiten la existencia de vida, es de suma importancia para poder pensar en resultados y proyectos más exitosos en un futuro. Es claramente visible que nos falta mucho por descubrir, sin embargo, Syn3.0 podría ser un excelente organismo mediante el cual lo científicos puedan entender como la materia inerte pueda pasar a ser vida y los genes imprescindibles para esta.
En el 2010, el grupo de investigación del Instituto Y. Graig Venter reportó que se llevó acabo la síntesis del cromosoma del Mycoplasma mycoides el cuál fue posteriormente trasplantado en el mycoplasma M.capricolum, al cual se le extrajo previamente el ADN. A este microbio se le llamó Sny 1.0, el cuál mostró una mayor afinidad para sintetizar proteínas de M. mycoides que de que des M, carpicolum, lo cual los llevó a dejar la información genética original a Sny 1.0.
En el recién proyecto, el equipo de investigación de Venter, se propuso identificar los genes esenciales para generar vida descartando los genes no esenciales en Sny 1.0 . Primero, se intentó diseñar, con ayuda del conocimiento ya existente, un cromosoma bacteriano con el menor número de genes posibles; sin embargo dicho proyecto falló.
Por otro lado, probando y errado, obtuvieron mejores resultados. Se dividieron los 901 genes de Sny 1.0 en 8 partes. Descartando y uniendo genes, se logró así el microbio Sny 3.0, con 407 genes.
Uno de los beneficios de la síntesis de Sny 3.0 es que al tener un genoma tan pequeño, experimentar con él traerá muchos beneficios y será más práctico para los investigadores. Entre las características de este microbio sintético, cabe destacar que se obtienen colonias en 3 horas, lo cual es algo muy ventajoso tomando en cuenta su corto genoma.
“Our current knowledge of biology is not sufficient to sit down and design a Iiving organism and build it”. - Craig Venter
El intentó de diseñar y construir un organismo falló, pero Syn 3.0 acerca un poco más a los científicos a entender en qué los estudios deben poner especial atención y nos recuerda que hay aún mucho por estudiar. Tal vez en un futuro, una vez entendidas las bases de la vida, se pueda ahora sí, diseñar y crear... Pero esto también implicaría muchas cuestiones éticas y filosóficas. Es inevitable no preguntar ¿se logrará?
Referencias: Service, R. (2016) Synthetic microbe has fewesr genes, but many mysteries. Science (351): 1380-1381.
bien!..aunque algo largo
DeleteGARIGLIO RANGEL ALDO FABIAN
ReplyDeleteSynthetic microbe has fewest genes but many misteries.
Este artículo trata sobre la búsqueda de los genes esenciales para la vida. Se menciona que el rango de genes que contienen los organismos es sumamente amplio, pues hay 280 mil veces más genes en el organismo con el mayor número de genes (Paris japónica) respecto del que tiene menos (Syn 3.0). Se hace implícito en el artículo que el microorganismo M. genitalium había sido hasta hace poco el organismo funcional con el menor número de genes (525). Sin embargo, a través de una serie de experimentos en los que se ha pasado el genoma de un microorganismo a otro y la reducción gradual del número de genes del mismo (eliminando los innecesario y los duplicados), se ha podido conocer qué tantos de ellos son imprescindibles. A partir de ello se ha podido crear un organismo funcional, el Syn 3.0 con solo 473. A pesar de este gran avance, un tercio de esos genes (149) sigue teniendo una función desconocida, por lo que queda implícito que se deben seguir las investigaciones para determinar el grado de importancia de éstos, lo cual pueda constituir un punto de referencia a partir del cual contrastar los genomas de otros organismos vivos obteniendo así información sobre sus funciones y su origen evolutivo.
bien
DeleteSÁNCHEZ HERRERA VICTORIA ABIGAIL
ReplyDeleteSynthetic microbe has fewest genes, but many mysteries
Robert F. Service
Una nueva herramienta biotecnológica
La creación de Syn 3.0, el microbio con el genoma más pequeño que se conoce en un organismo libre, realizada por investigadores liderados por Craig Venter, tiene el potencial de ser una valiosa herramienta biotecnológica, al permitir estudiar la función de los genes que se vayan agregando a él de forma individual.
El desarrollo de este microorganismo fue a base de ensayo y error, e implicó sintetizar el único cromosoma de Mycoplasma mycoides y dividirlo en 8 secciones de las cuales se determinó cuáles tenían información vital, también se eliminaron genes que no mostraron ser esenciales para obtener una célula viva, quedando únicamente 473 genes, que fueron implantados en M. capricolum.
Sin embargo, llama la atención el hecho de que aproximadamente un tercio de sus genes no tienen identificadas sus funciones a pesar de que se encontró que dichos genes son esenciales para obtener un organismo viable. Esto motiva una reflexión sobre qué tanto aún no sabemos sobre genómica y exactamente qué tan importante es el desarrollo de estas tecnologías. Por otro lado, nuestra creciente capacidad para diseñar organismos vivos podría crear un interesante debate sobre la ética de estos procedimientos.
Service, R. F. (2016) Synthetic microbe has fewest genes, but many mysteries. Science: 351, 6280 pp.1380
bien!
DeleteCruz Vargas Erick Leonardo.
ReplyDeleteLa ambición por encontrar genomas mayores llevó al equipo de Venter a diseñar bacterias para crear un gen mayor al del humano (París japónica) sin embargo al principio Venter y su equipo obtuvieron resultados distintos, los cuales dijo que no le sorprendían, los conocimientos biológicos no daban lo suficiente como para sentarse en un laboratorio y diseñar un organismo viviente y construirlo, se añadieron fragmentos de DNA para ensamblarlos de manera más fácil y así crear el genoma más pequeño.
Creo que al no tener el conocimiento de las funciones de una parte de sus genes que podrían realizar reacciones o actos de suma importancia nos dice de que a pesar de todos los avances aún nos falta mucho nppr descubrir en este aspecto y estar conscientes de que si seguimos con prueba y error, tal como lo hicieron Venter y sus colegas, podemos llegar a un punto en donde nos sea más fácil sintetizar genomas
muy confuso...pero lo leiste, lee con mas cuidado la proxima
DeleteMiranda Estrada Areli Yazmin
ReplyDeletePara empezar se debe mencionar el descubrimiento de la flor japonesa Paris Japónica que tiene 50 veces más DNA que un ser humano. Por otro lado esta Syn 3.0 con la menor cantidad de DNA y este está creciendo en una caja de petri en California.
Al inicio Voigt hace mención sobre la importancia de crear una célula viva cuyo genoma este completamente definido. Para esto lo que han hecho es agregar o quitar genes de una secuencia para ver cuáles son funcionales y cuáles no, cuales ayudaran a conseguir su objetivo y cuales son simple peso muerto en el complejo desarrollo de este trabajo. Básicamente crear un organismo biosintetico con tan pocos genes es cosa de probar y ver si funciona el poner un gen u otro, si no se debe sacar lo que estorba y volverlo a intentar y, si funciona dejarlo tal cual y anotar que es lo que dicho gen ha hecho para considerarlo una ayuda en su investigación.
Más tarde se habla de Venter, él fue el creador de Syn 3.0 pero este no fue el único organismo biosintetico que hizo, él y su equipo ya habían sintetizado antes el cromosoma de Mycoplasma Mycoides y lo trasplantaron a un cromosoma separado de M. capricolum del que previamente extrajeron DNA. Después de varios fallos vieron que al microbio sintético sintetizaba proteínas de forma normal echar por M. Mycoides en vez de M. capricolum.
En su actual trabajo Venter se propuso a determinar la mínima cantidad de genes para la vida extrayendo genes inescesarios de Syn 1.0. Su trabajo fue sumamente meticuloso pues dividieron los genes en 8 y buscaban en cada uno, de principio a fin, algo que pudiera ayudarlos a progresar en su investigación. Observaban con cuidado que genes al ser retirados anulaban la viabilidad del proyecto y solo de esa forma sabían que ese gen era el que necesitaban para lo que sería Syn 3.0. De esa forma fue como fueron reduciendo la cantidad de genes quedándose únicamente con los esenciales para la vida logrando así que Syn 3.0 terminara siendo, hasta ahora, el organismo biosintetico con menos genes en el mundo.
El trabajo me pareció interesante pues básicamente están desentrañando los secretos del origen de la vida pues solo están seleccionando los genes que ayudan a esto. Creo que hay muchas cosas en las que esto se puede aplicar aunque estas no se especifiquen en ninguna parte del artículo, pueden ser tanto cosas buenas como malas y por ahora espero que lo usen para algo bueno. Aun ahora no entiendo realmente porque es necesario que tenga tan pocos genes, ¿Eso influye en algo? ¿Qué tiene de malo que tenga más de los que ellos esperan? Tal vez solo quieren tener lo esencial pero sigue pareciéndome enigmático que no quieran tener un organismo complejo a base de lo más poco posible.
muy bien
DeleteSynthetic microbe has fewest genes, but many mysteries (ensayo #2)
ReplyDeleteAlumna: Rodríguez Blanco Fernanda
El artículo nos da a conocer la existencia de uno de los genomas más grandes , es 50 veces más grande que el de los seres humanos, es el de la flor japonesa Paris japonica. Pero por otro lado, también nos habla del genoma más pequeño : Syn 3.0.
Syn 3.0 cuenta con tan sólo 473 genes. Fue creado por investigadores de California en colaboración con Craig Venter (considerado uno de los padres del genoma humano ) con el fin de obtener una mínima cantidad de genes en algún organismo.
En el inicio de este proyecto, se sintetizó el cromosoma de Mycoplasma micoides y se trasplantó a Mycoplasma capricolum, al que con anterioridad de se le extrajo DNA. El resultado fue que éste logró sintetizar proteínas de M. Micoides, esto se pudo ver como un gran logro para comenzar a crear vida sintética
Posteriormente, se quiso lograr que el organismo tuviese los genes más esenciales para su supervivencia pero, no fue posible. Sin embargo, se perfeccionó la técnica para reducir el genoma; dividieron el genoma de Mycoplasma micoides en ocho secciones y, removieron algunos genes con el fin de saber si eran vitales o no para llevar a cabo la duplicación. Fue así como redujeron el genoma original de Mycoplasma micoides, dando como resultado el organismo con el genoma más pequeño del mundo, sin embargo, se desconocen las funciones de al menos 149 genes pero, el nuevo reto es continuar con las investigaciones y descubrir en qué consisten.
Evidentemente se ha logrado avanzar en los análisis del genoma, pero queda claro que aún hay muchas cosas por descubrir porque, no es sencillo saber cómo los genes pueden controlar el funcionamiento de la vida. Las fallas que se encontraron en el proyecto quedan presentes para futuros trabajos pero ayudan a entender la complejidad con la que se va a trabajar.
bien!
DeleteSynthetic microbe has fewest genes, but many mysteries
ReplyDelete¿Podemos diseñar y crear un organismo a partir de un genoma?
Un equipo de investigadores liderado por Craig Venter (pionero en la secuenciación del ADN) diseñaron una bacteria con la menor cantidad de genes presentes en cualquier organismo viviente “Syn 3.0” junto con otros prototipos antetiores (Syn 2.9, Syn 1.0). El proceso es descrito como “prueba y error”, dividieron el genoma de Syn 1.0 y sus 901 genes en 8 secciones, separaron por módulos cada sección y fueron borrando pedazos de ADN hasta identificar que partes son esenciales y cuáles no, Venter hace una analogía con aviones que explica a grosso modo este proceso:
"Si no sabes nada de aviones, y estás estudiando el funcionamiento de las partes de un Boeing 777 eliminando una a una, y quitas el motor del ala derecha, el avión todavía puede aterrizar"
"Así que puedes decir que ese motor no es un componente esencial, pero no descubrirás su importancia hasta que no quites el segundo motor".
"Y esto es lo que ocurre una y otra vez en la biología, donde tenemos lo que parece ser un componente no básico, hasta que eliminamos a su homólogo".
Representa un gran paso para crear la primera célula sintética, sin embargo Venter afirma que nuestro conocimiento actual en biología no es suficiente para diseñar y construir un organismo viviente.
Y es en este tipo de experimentos cuando la ciencia más necesita de la ética, para funcionar como una guía moral y es cuando más necesitamos visualizar un panorama amplio y dirigido hacia el futuro, ¿Hasta qué punto llegarán nuestros conocimientos para crear vida?
bien!
DeleteOmar Josue Obregón Portugal
ReplyDeleteMicrobio sintético tiene pocos genes, pero muchos misterios.
Este artículo nos informa acerca de una bacteria llamada Syn 3.0, la cual fue modificada con ingeniería genética para tener el genoma más pequeño, y el menor número de genes que se conoce, 473 para ser exactos. Contando prácticamente solo con lo necesario para vivir y reproducirse.
Sin embargo aunque se tiene el genoma completamente definido de esta singular bacteria, la función de una tercera parte de sus genes sigue siendo desconocida. Lo que hace que los investigadores se interesen en buscar la función de esos genes, lo que promete nuevos conocimientos sobre la biología básica de la vida.
Anteriormente ya habían sido creadas dos bacterias similares a esta (Syn 1.0 y Syn 2.0) las cuales fueron creadas con el objetivo de determinar el número de genes necesarios para la vida, removiendo aquellos que no se consideran necesarios, hasta dejar al microorganismo con el menor número de genes indispensables. Para luego tratar de diseñar un cromosoma bacteriano con el genoma mínimo hipotético, que luego tendría que ser sintetizado en un M. Capricolum, para ver si se podía forma un organismo vivo viable. Aunque el resultado fue un fracaso, demostrando que aún nos faltan conocimientos para crear vida en un laboratorio.
Sin embargo se remontó a una idea anterior, con Syn 1.0 una bacteria, dividieron sus 901 genomas en 8 secciones, añadiendo ADN al principio y al final de cada sección, haciendo fáciles de montar. Esto les permitió tratar a las secciones como módulos independientes, removiendo una por turno y borrando pedazos de ADN, para luego re ensamblar el genoma completo e insertarlo de nuevo en M, Capricolum para ver si se produce una célula viva.
Después de estos y cientos de experimentos más se logró recopilar la información necesaria para facilitar esta misma experimentación sobre Syn 3.0, aunque el equipo de investigación Venter dice que en un futuro se podría crear una bacteria con todavía un menor número de genes.
Como podemos observar en este artículo, la manipulación genética de los organismos ha avanzado mucho, a tal grado de acércanos a la comprensión de cómo funciona la vida en los organismos más simples como para casi poder crearlos artificialmente en un laboratorio. He ahí de la importancia de bacterias como Syn 3.0 , la cual es el futuro a una nueva fuente de conocimiento sobre la vida.
bien!
DeleteTeresa Guadalupe Mateos Pimentel
ReplyDeleteSynthetic microbe has fewets genes, but many mysteries.
La idea principal de el articulo es hablar sobre los genomas(implicando en ello el tamaño) y el numero de los genes que lo constituyen.
Se habla princípalmete de Syn 3.0 una bacteria creada en un laboratorio de California. Syn 3.0 tiene el genoma mas pequeño y con el menor numero de genes, contando con solo 473 genes. Esta bacteria tenia facinados a los biólogos y bioquímico, quienes dijeron que estudiarían cada uno de sus genes, ya que la función 1/3 de los genes de Syn 3.0 era totalmente desconocido, la tarea de estos investigadores era probar los roles de estos genes que prometían nuevos conocimientos en la biología basica de la vida.
Antes de la creación de 3.0 hubo otros que fueron syn 2.0 y syn 1.0.
El equipo de Venter reporto que tuvieron que sintetizar el único cromosoma de Micoplasmic mycoides, una bacteria con un genoma relativamente pequeño y trasplantarlo dentro de un micoplasma separado llamado M. capricolum para la cual tuvieron que previamente extraer DNA, después de intentos fallidos mostraron que este microbiosintetico produjo proteínas normales hechas por M. mycoides mojor que M. capricolum. Buscaban diseñar un microbio con el minimode genes para ver quien producia un organismo viable . Pero fallaron ya que el conocimiento acerca de sto no era lo suficientemente avanzado.
Dividieron Syn 1.0 con 901 genes en ocho secciones y al principio y al final de cada sección incluyeron DNA que hacia mas fácil armar la piezas y luego rearmando el genoma completo y ensamblándolo en M. capricolum con el fin de ver si producia una celula viva. Si el genoma no era viable sabían que tenían que cortar un gen escencial y restaurarlo de nuevo.
Veter y su equipo construyo, diseño y probo ciemtos de contrucciones antes de Syn 3.0 con un genoma de casi la mitad del tamaño de Syn 1.0, siendo Syn 2.0 un intermedio en este proceso con 525 genes.
Veter destaca que 3.0 probablemente hará la vida mas fácil para los futuros biólogos sintéticos que podrían hacer una bacteria con menos numero de genes que Syn 3.0. Pero que hasta entonces Syn 3.0 tenia el "campeonato d peso ligero".
A mi opinión esto ha contribuido una gran avance tecnológico y nos a hecho pensar que aun nos falta mas por descubrir ya si mismo conocer que existe la capacidad de producir microbios sintéticos con características cada vez mas complejas e impresionantes.
bien!
Deletebien!
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ReplyDeleteAntal Moreno Espinosa
ReplyDeleteEl artículo habla sobre un microbio sintético creado en cajas petri en California, E. U. A. El autor principal de este proceso es Craig Venter, el cual es un pionero en secuenciación genómica. El organismo del que se habla lo han llamado Syn 3.0 y su característica principal es la de tener la menor cantidad de genes posibles (pero suficientes) para sobrevivir y reproducirse. El número de genes que este microbio tiene es 473, sin embargo, alrededor de un tercio de esta cantidad son genes de los cuales se desconoce su función. No obstante este es un gran paso para la biología sintética.
El proceso de la creación de este organismo no fue una tarea fácil ya que este es solo el resultado de un largo período de prueba y error por parte de Venter y su equipo. El antecesor de Syn 3.0 fue Syn 1.0, un microbio sintetizado (igualmente por Venter) en el año 2010 y que constaba de 901 genes. Fue a partir de ese microbio que comenzaron los intentos de reducir su genoma a lo meramente esencial. Fue un proceso largo que constaba de extraer, cortar y "pegar" pedazos o trozos del genoma de Syn 1.0, pero después de varios intentos lograron llegar a lo que ahora se conoce como Syn 3.0.
Creo que es un buen artículo ya que define y describe el proceso de "construcción" de Syn 3.0 a partir de Syn 1.0. Demuestra que detrás de un descubrimiento hay mucho esfuerzo de los investigadore y colaboradores, y que estos procesos duran años. Algo muy importante es que este tipo de investigaciones abre camino a más investigaciones y ya no tienen que comenzar desde cero.
tarde pero bien...
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