Profesora: dra. Valeria Souza Saldivar
Examen 1 a casa
entregar 13 de octubre, 2016 junto con TODAS las
lecturas
Pregunta 1
Dibuja con
gran detalle la escala de tiempo desde el origen de la tierra, de la luna, los
escenarios del origen de la vida y su desarrollo a un ancestro comun reflejando
las discusiones del genoma mínimo. En ella tambien explica con cuidado las condiciones
de la Tierra primitiva en el Archeano y el surgimiento de los tapetes
microbianos. Incluye la primera
bola de hielo, el Proteozoico como un mundo de estromatolitos
y el origen de los eucariontes y el papel de las
mitocondrias. Pon también la segunda bola de nieve y explica como esto cambio al
mar. Terminando con la
explosión del Cámbrico.
(2.5 puntos)
Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el
contexto correcto. Puedes
consultar libros y lo que encuentres en internet al respecto siempre y cuando
lo cites de la manera adecuada.
1. Leroy Cronin y Sara Imari Walker. 2016.
Beyond prebiotic chemistry. Science:352, 6290.
2. Robert F. Service
, 2016, Synthetic
microbe has fewest genes, but many mysteries Science: 351, 6280, pp 1380
3. Laurel Hamers 2016, Why do cells’ power
plants hang on to their own genomes? Science 351: 6276 903
Pregunta 2
Discute el
sugimiento del flujo de electrones en un ambiente mineral y el origen de la
ATPasa con el ATP como“moneda
energética”insertada
dentro de las membranas y
como funcionan las reacciones redox. Con estos elementos explica las cuidado
las dos vias alternas de obtener energía de manera autotrofa: la
quimiolititrofía (metanogenesis) y la Fotosíntesis tanto anoxigénica como la fotosíntesis oxigénica.
(2.5 puntos)
Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto
correcto.
4. Thomas J. Lawton and Amy C. Rosenzweig.
2016, Methane, make it or break it. Science:352, 6288 pp 892.
5.
Günter Fritz1 and Peter M. H. Kroneck 2016. Sulfate to go. Science,
350:6267 pp1476
6.
Elizabeth B. Kujawinski, Mary Ann Moran, Aron Stubbins, and Rob Fatland 2016.
The Ocean Microbiome: Metabolic Engine of the Marine Carbon Cycle Microbe, 11:
6 262-267.
3. Describe con cuidado los diversos phyla cultivables de Bacteria y Archea
y compara ese conocimiento con lo que sabemos de los phyla de Bacteria y Archea
no cultivables. Discute la diferencia.
(2 puntos)
Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto
correcto.
7. Emma
Schwager, Chengwei Luo, Curtis Huttenhower, and Xochitl C. Morgan 2015 •Genomic
Sequencing and Other Tools for Studying Microbial Communities. Microbe. 10:10,
419
8. Carol
Potera 2016. Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life.
Microbe: 11, 7 pp 292
9. Karen
Lloyd, 2015, Beyond known methanogens. Science 350:6259 pp384
4. Explica las diferentes escalas de estudio de
la ecología retomando el papel de las bacterias en cada una de las escalas.
Individuo-Microbioma.
Poblaciones con el gradiente de interacciones organismo grande-microbio.
Comunidades y su microbioma
Ecosistemas con el papel de las bacterias en el
reciclaje de nutrientes.
(3 puntos)
Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto
correcto.
10.
Mary Ann Moran 2015.The global ocean microbiome. Science 350:6266 pp 1330
11.
Marcia Stone 2016 Root and Gut Microbiomes Are Strikingly Similar
Microbe,11: 3 pp. 107
12. Eugene
Rosenberg and Ilana Zilber-Rosenberg 2016. Bacterial Bleaching of Corals Leads
to Hologenome Concept Microbe 11:1 pp. 27-31.
13.
Shannon Weiman. 2016. Antibiotic Resistance Spreads through Diverse Species and
Habitats, Part I Microbe 11:5 pp. 201-207
14.
Julia K. Goodrich, Emily R. Davenport, Jillian L. Waters, Andrew G. Clark, Ruth
E. Ley. 2016. Cross-species comparisons of host genetic associations with the
microbiome. Science, 352: 6285 pp 532-535.