Examen 1

Profesora: dra. Valeria Souza Saldivar

Examen 1 a casa

entregar 13 de octubre, 2016 junto con TODAS las lecturas

Pregunta 1

Dibuja con gran detalle la escala de tiempo desde el origen de la tierra, de la luna, los escenarios del origen de la vida y su desarrollo a un ancestro comun reflejando las discusiones del genoma mínimo. En ella tambien explica con cuidado las condiciones de la Tierra primitiva en el Archeano y el surgimiento de los tapetes microbianos. Incluye la primera bola de hielo, el Proteozoico como un mundo de estromatolitos y el  origen de los eucariontes y el papel de las mitocondrias. Pon también la segunda bola de nieve y explica como esto cambio al mar. Terminando con la explosión del Cámbrico.

(2.5 puntos)

Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto correcto. Puedes consultar libros y lo que encuentres en internet al respecto siempre y cuando lo cites de la manera adecuada.

1. Leroy Cronin y Sara Imari Walker. 2016. Beyond prebiotic chemistry. Science:352, 6290.

2. Robert F. Service
, 2016, Synthetic microbe has fewest genes, but many mysteries Science: 351, 6280, pp 1380

3. Laurel Hamers 2016, Why do cells’ power plants hang on to their own genomes? Science 351: 6276 903

Pregunta 2

Discute el sugimiento del flujo de electrones en un ambiente mineral y el origen de la ATPasa con el ATP como“moneda energética”insertada dentro de las membranas y como funcionan las reacciones redox. Con estos elementos explica las cuidado las dos vias alternas de obtener energía de manera autotrofa: la quimiolititrofía (metanogenesis) y la Fotosíntesis tanto anoxigénica como la fotosíntesis oxigénica.

(2.5 puntos)

Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto correcto.

4. Thomas J. Lawton and Amy C. Rosenzweig. 2016, Methane, make it or break it. Science:352, 6288 pp 892.

5. Günter Fritz1 and Peter M. H. Kroneck  2016. Sulfate to go. Science, 350:6267 pp1476

6. Elizabeth B. Kujawinski, Mary Ann Moran, Aron Stubbins, and Rob Fatland 2016. The Ocean Microbiome: Metabolic Engine of the Marine Carbon Cycle Microbe, 11: 6 262-267.

3. Describe con cuidado los diversos phyla cultivables de Bacteria y Archea y compara ese conocimiento con lo que sabemos de los phyla de Bacteria y Archea no cultivables. Discute la diferencia.

(2 puntos)

Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto correcto.

7. Emma Schwager, Chengwei Luo, Curtis Huttenhower, and Xochitl C. Morgan 2015 •Genomic Sequencing and Other Tools for Studying Microbial Communities. Microbe. 10:10, 419

8. Carol Potera 2016. Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life. Microbe: 11, 7 pp 292

9. Karen Lloyd, 2015, Beyond known methanogens. Science 350:6259 pp384  

4. Explica las diferentes escalas de estudio de la ecología retomando el papel de las bacterias en cada una de las escalas.

Individuo-Microbioma.

Poblaciones con el gradiente de interacciones organismo grande-microbio. Comunidades y su microbioma

Ecosistemas con el papel de las bacterias en el reciclaje de nutrientes.

(3 puntos)

Utiliza las referencias leidas en clase y ponlas en el contexto correcto.

10. Mary Ann Moran 2015.The global ocean microbiome. Science 350:6266 pp 1330

11. Marcia Stone 2016 Root and Gut Microbiomes  Are Strikingly Similar Microbe,11: 3 pp. 107

12. Eugene Rosenberg and Ilana Zilber-Rosenberg 2016. Bacterial Bleaching of Corals Leads to Hologenome Concept Microbe 11:1 pp. 27-31.

13. Shannon Weiman. 2016. Antibiotic Resistance Spreads through Diverse Species and Habitats, Part I Microbe 11:5 pp. 201-207

14. Julia K. Goodrich, Emily R. Davenport, Jillian L. Waters, Andrew G. Clark, Ruth E. Ley. 2016. Cross-species comparisons of host genetic associations with the microbiome. Science, 352: 6285 pp 532-535.