La bacteria del estómago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos más frecuentes ya que ésta infecta el epitelio gástrico. Este patógeno se ha extendido globalmente, resultando en un patrón filogeográfico distinto que puede usarse para reconstruir migraciones humanas recientes y antiguas. En Europa se sabe que el H. Pylori es un híbrido entre las bacterias asiáticas y africanas, pero existen diferentes hipótesis sobre cuándo y dónde tuvo lugar ésta hibridación, lo que por ende nos refleja la compleja historia demográfica de los europeos. En este artículo presenta un H. Pylori de 5300 años de antigüedad. En una momia europea que se localizó en un glaciar, se encontró el genoma de un H. Pylori; esta es una muestra pura representativa de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de la hibridación; esto nos sugiere que la población africana llegó a Europa en los últimos miles de años. Este patógeno ha evolucionado para poder subsistir en el medio ácido del estómago humano. Casi toda la población mundial porta esta bacteria en su estómago y por lo menos el 10% de los portadores desarrollan una enfermedad que se manifiesta como úlceras estomacales o carcinoma gástrico. Por lo tanto, la bacteria ha sido utilizada como marcador para rastrear eventos demográficos complejos en la prehistoria humana. En este estudio, seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, que es una momia de edad de cobre de 5 300 años de antigüedad, en donde se encontró la presencia de H. Pylori. Los análisis de isótopos estables mostraron que el Iceman se originó y vivió en el sur de Europa, en el extremo oriental de Italia. Genéticamente, se parece más a los primeros europeos. El material de estudio incluía el contenido en el cuerpo, el tejido mucoso y el contenido del intestino delgado y del intestino grueso. Haciendo una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) directa, los diagnósticos metagenómicos y la captación del genoma dirigida, determinaron la presencia de H. Pylori y se reconstruyó su complejo genoma. Demostraron que esta bacteria se originó cuando se recombinaron dos poblaciones ancestrales de Europa. Se cree que una de esas poblaciones se originó en Asia central y la otra parece haber evolucionado en el noreste de África, que en algún momento recombinaron en la versión europea actual. Además, los resultados de nuestra ancestralidad indican que la cepa de Iceman pertenecía a una rama europea prehistórica de hpAsia2 (que son las distribuciones fitogeográficas) que es diferente de la población moderna de hpAsia2 del norte de la India. La gran similitud genética de la antigua cepa de la bacteria de Europa implica que gran parte de la diversidad presente en la Europa de la etapa de Cobre todavía se mantiene dentro de la población hpEuropa existente, a pesar de los milenios de la posterior introducción de AE2. Con esto nos damos cuenta de que los humanos ya estábamos infectados con esta bacteria desde el comienzo de nuestra historia y que la evolución de H. pylori es que hubo dos cepas originales, una africana y otra asiática, que en algún momento se recombinaron para formar la actual cepa europea.
La bacteria del estomago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos mas frecuentes. Se ha dispersado globalmente con su huésped humano dando como resultado un patrón filogeografico que puede usarse para reconstruir tanto las migraciones humanas recientes como antiguas. Aquí se presenta un genoma de H. pylori de 5300 años de edad de una momia Europea del glaciar de la era del cobre. El hombre de hielo H. pylori es antes de la hibridacion, lo que sugiere que la población africana llego a Europa dentro. Hoy en día esta bacteria Gram-negativa se encuentra en casi la mitad de la población humana del mundo. La moderna cepa H. pylori encontrada en la mayoría de los europeos supuesta mente se origino de la recombinación de las dos poblaciones ancestrales Ancestral 1 y 2. Se seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal de esta momia-, esto mediante el uso directo de la reacción en cadena de la polimerasa , el diagnostico metagenomico, y la captura del genoma, se determino la presencia de H. pylori y se reconstruyo su genoma completo. Debido a las delaciones, el numero de variantes genomicas esta ligeramente por debajo del rango de lo que puede observarse entre as cepas modernas de H pylori. El análisis secuencial posterior clasifico al H. pylori antigua, como una cepa tipo cagA-positivo vacA que ahora esta asociada con la inflamación de la mucosa gástrica. En total 22 proteínas observadas en el proteoma del estomago del Hombre de Hielo se expresan en neutrofilos y están implicadas en la respuesta del huésped inflamatorio. Por lo tanto el estomago del hombre de hielo fue colonizado por una cepa de tipo H. pylori cito-toxica resultado de la respuestas inmunes inflamatorias del huésped. La antigua H. pylori del hombre de hielo se separo de las cepas modernas de hpEurope y su posición a lo largo de PCL estaba cerca de las cepas modernas de hpAsia2 de la India que reflejaban si AEi casi puro y sus ancestros AE2 muy bajos.
El genoma de pylori de Helicobacter de 5300 años del hombre de hielo La bacteria del estómago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos más frecuentes. Y se ha dispersado globalmente con su anfitrión humano, dando por resultado un patrón filogeográfico distinto que puede utilizarse para reconstruir tanto recientes como antiguas migraciones humanas El altamente patógeno recombinante Helicobacter pylori ha evolucionado para vivir en el ambiente ácido del estómago humano. Hoy en día, esta bacteria gram negativa se encuentra en aproximadamente la mitad la población del mundo humano, pero menos del 10% de los portadores desarrollan la enfermedad que se manifiesta como úlceras de estómago o carcinoma gástrico El patógeno no sólo acompañó a los seres humanos modernos fuera de África, sino que también se ha asociado con su huésped durante al menos 100.000 años. Así, la bacteria se ha utilizado como un marcador de eventos demográficos complejos de seguimiento en la prehistoria humana. Cepas de pylori H. moderna han sido asignadas a poblaciones distintas según su origen geográfico La cepa de pylori H. moderno encontrada en la mayoría de los europeos supuestamente se originó de la recombinación de las dos poblaciones ancestrales, la zona de hibridación precisa de las poblaciones parentales y el verdadero origen son polémicos En este estudio, defendieron a 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del “hombre de hielo”, una momia 5300 años de edad del cobre, la presencia de H. pylori. Análisis de isótopos estables demostraban que se originó y vivió en el sur de Europa, en los Alpes italianos orientales. Genéticamente, se asemeja a los agricultores europeos tempranos Mediante el uso directo de la polimerasa reacción en cadena (PCR), diagnósticos de metagenómica y genoma objetivo capturan la presencia de H. pylori y reconstruyen su genoma completo. La distribución a lo largo del tracto intestinal del hombre de hielo es similar a la de los seres humanos modernos del H. pylori positivos
Análisis de la secuencia subsecuente clasifica el antiguo H. pylori como una cepa de tipo s1a/i1/m1 vacA cagA-positivo que está ahora asociado con la inflamación de la mucosa gástrica. Así se concluye que el estómago del hombre de hielo fue colonizado por una citotóxica H. pylori – tipo tensión que activa la liberación de CP como consecuencia de la respuesta inmune inflamatoria del huesped. Sin embargo, si el hombre de hielo sufrió de enfermedad gástrica no puede determinar a partir de nuestro análisis debido a la pobre preservación de la mucosa del estómago Además, nuestros resultados de ascendencia Co indican que la cepa del hombre de hielo pertenecieron a una rama europea prehistórica de hpAsia2 que es diferente de la población de hpAsia2 moderna del norte de la India. La alta semejanza genética de la cepa antigua a las bacterias de Europa implica que gran parte de la diversidad presente en la edad de cobre en Europa todavía se mantiene
Este es un claro ejemplo de como la biología nos puede ayudar al estudio de otras áreas no sólo científicas, si no también históricas. Helicobacter pylori es un patógeno muy común presente en la raza humana que esta relacionado con la inflamación de la mucosa gástrica y puede brindarnos información sobre las migraciones que se han presentado en la historia, esta bacteria se clasifica según sus orígenes geográficos pero se cree que el tipo presente en Europa es un hibridación de la bacteria Asiática y Africana. Esta hibridación pudo haber ocurrido en el medio oriente de Asia entre hace 10,000 y 52,000. El hombre de hielo es una momia de 5300 años de antigüedad de la parte Sur de Europa, específicamente del Este de Italia, sirvió para demostrar estas teorías, se realizaron 12 biopsias en donde se encontró la presencia de H. Pylori en todos los tractos gastrointestinales y se reconstruyó su genoma. Se encontraron solo ligeras variaciones de las características de na bacteria actual pero también se encontró una estructura muy común de la parte centra y sur de Asia. En resumen la bacteria encontrada en el hombre de hielo es mas cercana a ancestros asiáticos que puramente europeos. El llegar a conocer estos orígenes de las bacterias que se encuentran en nuestro organismo nos permite tener una mejor idea sobre las migraciones ocurridas en la historia de la humanidad e incluso nos remota a interacciones humanas que no se pensaban antes pero que hoy marcan la linea sobre la cual se presenta nuestro microbioma; las bacterias nos pueden ayudar a conocer nuestro futuro pero también conocer partes de la historia que no se sabían.
“The 5300-year-old Helicobacter pylori genome ofthe Iceman”
Uno de los patógenos más influyentes en el ser humano es la bacteria Helicobacter pylori que se encuentra en el estómago. Gracias al ser humano se ha dispersado globalmente. En Europa la H. pylori es conocida por un ser hibrido entre las bacterias de Asia y África, sin embargo existen diferentes hipótesis sobre cuándo y donde tuvo lugar esta hibridación.
Se ha presentado un genoma de H. pylori de una momia glaciar europea de 5300 años de edad. El hombre de hielo tiene una H. pylori que es casi una representante pura de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de la hibridación. H. pylori es un patógeno altamente recombinante que ha evolucionado para vivir en el ácido del estómago, es una bacteria Gramnegativa que se encuentra en aproximadamente la mitad de la gente. La asociación de esta bacteria con los seres humanos da lugar a un patrón filogeografico así esta bacteria tiene utilidad como un marcador para el rastreo de eventos demográficos en la prehistoria humana.
Se realizó un estudio del hombre de hielo seleccionando 12 biopsias de su tracto gastrointestinal, este estudio mostro que el hombre de hielo se originó y vivió en el Sur de Europa. El estómago del hombre de hielo aun tenia restos de la comida que ingirió poco antes de su muerte esto fue material de estudio en conjunto con un tejido mucoso, contenido del intestino delgado y contenido del intestino grueso. Mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa y diagnósticos genómicos se determinó la presencia de H. pylori en su genoma completo. Una secuenciación también arrojó que el H. pylori del hombre de hilo es una cepa que está asociada con la infamación de la mucosa gástrica por lo que el estómago del hombre de hielo fue colonizado por una H. pylori citotóxica como consecuencia de la respuesta inmune inflamatoria del huésped. También gracias a esta información pudieron comparar esta bacteria con otras actuales buscando el origen de H. pylori.
La falta de conocimiento de algunas interacciones como a hibridación en H. Pylori entre bacterias asiáticas y africanas hace que la demografía se torne un tanto compleja, sin embargo, H. pylori, que se encontró en una momia de glaciar, muestra la existencia de población bacteriana de origen asiático por lo que se sugiere fue antes de la hibridación haciendo suponer que la población africana llegó después. Éste patógeno debió evolucionar para poder vivir en el ambiente ácido del estómago, tanto ha sido su evolución que hoy en día se puede encontrar en aproximadamente la mitad de la población humana en el mundo, en los portadores que suelen desarrollar la enfermedad, se manifiesta con úlceras o carcinomas gástricos. La distribución filográfica de H. pylori ha sido predominantemente por transmisión intrafamiliar. En cuanto a la recombinación e hibridación, su origen es controvertido, aún no se sabe con certeza en donde se originó, distintas frecuencias se han atribuido a eventos de poblamiento independientes que eventualmente se recombinaron con componentes ancestrales de H. pylori en Europa. Con ayuda de la metagenómica se pudieron producir DNA endógeno de H. pylori en el tracto gastrointestinal y otras lecturas más llevaron a asimilarse a la de los humanos modernos, así mismo, los comparativos de todo el genoma confirmaron la similitud que tiene con el de la inda, lo que indica la diversidad en Europa del cobre y la Europa moderna a pesar del paso de los años.
La bacteria patógena gram negativa Helicobacter pylori es altamente recombinante y ha evolucionado para vivir en el ambiente ácido del estómago humano. Actualmente es uno de los patógenos más frecuentes presente en más de la mitad de la población humana, aunque menos del 10% de los portadores desarrollan una enfermedad que se manifiesta como úlceras estomacales o carcinoma gástrico. H pylori se ha distribuido globalmente junto con su hospedador humano como resultado de un patrón de distribución filogeográfico distinto. Precisamente por el hecho de que la bacteria haya acompañado a su hospedador durante al menos 100 000 años, permite su uso como marcador para el rastreo de eventos demográficos complejos en la prehistoria humana. Las cepas modernas de H. pylori se han asignado a poblaciones según su origen geográfico (hpEurope, hpSahul, hpEastAsia, hpAsia2, hpNEÁfrica, hpAfrica1 y hpAfrica2) que son derivados de al menos 6 fuentes ancestrales. En el caso de hpEurope, la cepa actual encontrada en la mayoría de los europeos, supuestamente se originó de la recombinación de 2 poblaciones ancestrales (AE1 y AE2). Paralelo a esto se sugiere que AE1 tuvo su origen en Asia donde evolucionó a hpAsia2 que actualmente se encuentra en el sur de Asia. Pero por otro lado AE2 parece haber evolucionado del noreste de África y se posteriormente hibridarse con AE1 para convertirse en hpEurope, sin embargo la zona precisa de hibridación de las poblaciones parentales y el verdadero origen de dicha cepa son polémicos. Recientemente se ha sugerido que la AE1/AE2 podría haber ocurrido en el Oriente medio o en Asia Occidental en un período de hace 10 000 a 52 000 años y que las cepas recombinantes fueron introducidas en Europa con los primeros recolonizadores humanos después del último glacial máximo. En este artículo, se realizó un estudio donde se seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del “hombre de hielo” una momia de la Edad de Cobre con 5300 años de antigüedad y con la presencia de H. pylori. Los análisis de isotopos estables mostraron que el hombre de hielo se originó y vivió en el Sur de Europa, en los Alpes Italianos Orientales, genéticamente más parecido a los primeros agricultores. Su estómago fue descubierto en una evaluación de los datos radiológicos y contenía la comida que ingirió poco antes de su muerte. Dentro del material de estudio se incluyeron: el contenido del estómago, el tejido mucoso y el contenido del intestino delgado y grueso. Mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), diagnósticos metagenómicos y por captura de genoma dirigido, se determinó la presencia de H. pylori y se reconstruyó su genoma. El análisis metagenómico arrojó DNA de H. pylori (15350 lecturas) en todos los contenidos del tracto gastrointestinal, las lecturas no ambiguas recuperadas se alinearon con un genoma de referencia moderno de H. pylori. El genoma de H. pylori del hombre de hielo tenía 43 000 Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y 39 deleciones. Además, como se esperaba para esta bacteria altamente recombinante, se encontró evidencia de inserciones de genes de cepas de H. pylori que difieren del genoma de referencia. El estómago del hombre de hielo fue colonizado por una cepa de tipo H. pylori citotóxica que desencadenó la liberación de calprotectina como resultado de las respuestas inmunes inflamatorias del hospedador. Sin embargo, no es posible determinar si sufrió de una enfermedad gástrica. La detección de una cepa hpAsia2 en el estómago del hombre de hielo es muy sorprendente ya que sólo se han encontrado 3 cepas de hpAsia2 en europeos modernos. La antigua cepa de H. pylori proporciona la primera evidencia de que AE2 ya estaba presente en el centro de Europa durante la edad del cobre pero en un nivel muy bajo, lo que sugiere que la mayor parte de la ascendencia de AE2 observado en hpEurope hoy en día es resultado de la introgresión posterior de AE2.
El en articulo se explica el desarrollo de un estudio hecho sobre la bacteria: Helicobacter pylori de 5300 años de edad, encontrada en una momia europea. Debido a que es uno de los patógenos más frecuentes en el ser humano se hace una breve introducción explicando que esta bacteria es filogeográfica (acompaña al hombre en cualquier lugar) y altamente evolucionada, ya que se adapta a los ácidos del estomago y se encuentra en la mitad de la población del mundo; además de servir como marcador histórico en los eventos demográficos de la prehistoria, en regiones especificas y con ancestros comunes en cada lugar.
Se tiene una hipótesis de la recombinación de las especies ancestrales que dieron origen a la actual H pylori, entre una cepa Europea y otra Occidental, por lo que el nuevo descubrimiento sirvió de gran utilidad para esclarecer esta duda. Donde se uso directamente la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la captura del genoma objetivo, lo que dio paso a la reconstrucción de su genoma, siendo similar a la actual H. pylori (cepa 26695). Posteriormente se mejoro el ADN utilizando la captura de hibridación en solución, con lo que se obtuvieron ~ 43.000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y 39 supresiones que oscilaban entre 95 pares de bases (pb); y se encontró evidencia de inserciones de cepas de H. pylori que difieren del genoma de referencia.
Se clasifico a la cepa como tipo vacA s1a / i1 / m1 cagA-positiva, asociada con la inflamación de la mucosa gástrica, después de realizar comparaciones con cepas actuales y recombinadas se localizo una cepa diferente en la misma momia: la cepa hpAsia2, que está sumamente relacionada con tres genomas de la India; debido a que no se tiene una coincidencia más grande ,los científicos realizaron un análisis de alta resolución de los motivos ancestrales utilizando multaSTRUCTURE, lo que dio como resultado el compartimiento ancestral con la cepa moderna de AE2. Con ello se podría confirmas que esta cepa es desarrollada en la Europa antigua (edad de cobre); pero debido al tamaño de la muestra no puede hacerse una afirmación contundente; es necesario el análisis de mas cepas antiguas.
Genoma de Helicobacter pylori de 5300 años de edad
La bacteria patógena y altamente recombinante Helicobacter pylori es una de las más predominantes y globalmente dispersas, se encuentra en aproximadamente la mitad de la población humana, afortunadamente menos del 10% de los portadores desarrollan la enfermedad consistente en úlceras estomacales o carcinoma gástrico. Su distribución mundial al lado de los humanos junto con su alta tasa de recombinación genética ha generado un patrón filogeográfico que permite reconstruir migraciones humanas tanto recientes como antiguas.
La cepa moderna de Helicobacter pylori encontrada en la mayoría de la población europea (hpEurope) se originó de la recombinación de dos poblaciones ancestrales: AE1, que se cree se originó en Asia Central y AE2 que se originó en el noreste de África y generó a hpEurope por hibridación con AE1. El lugar preciso donde la hibridación ocurrió y el verdadero origen de hpEurope son controvertidos.
El artículo nos presenta un estudio de 12 biopsias del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, una momia de la era del cobre de 5300 años, que se originó y vivió en el sur de Europa, en los alpes italianos. Las biopsias incluían contenido estomacal, tejido de mucosa y contenidos del intestino delgado y grueso, y por medio de reacción en cadena de polimerasa, diagnóstico metagenómico, y captura dirigida del genoma se determinó la presencia de Helicobacter pylori y se reconstruyó su genoma completo. Se determinó que la momia sólo estaba infectada con una cepa de Helicobacter pylori, perteneciente a la población moderna hpAsia2 común en el centro y el sur de África y muy rara entre europeos. Análisis posteriores revelaron que esta cepa sólo contenía un 6.5% del componente ancestral AE2 DE hpEurope, lo cual implica que su ancestria es casi completamente de AE1. Desafortunadamente, la muestra con que se trabaja es insuficiente para obtener conclusiones acerca de la prevalencia de AE1 en la Europa antigua y de la introducción de AE2; sin embargo, sí provee evidencia de que AE2 se introdujo en Europa desde África tras la era de bronce, que es después de lo que se suponía .
Referencia Maixner, F. et al. (2016) The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351:6269, pp 162-165.
El altamente recombinante patógeno Helicobacter pylori se ha asociado con su hospedero (el humano) por al menos 100,000 años, evolucionó para vivir en el estómago humano y se encuentra en aproximadamente la mitad de la población. Es gracias a esto que la bacteria ha sido utilizada como marcador para hacer un seguimiento de los eventos demográficos en la prehistoria humana y rastrear las migraciones. Cepas actuales de H. pylori han sido asignadas a distintas poblaciones de acuerdo a su origen geográfico (hpEurope, hp.Sahul, hpEastAsia, hpAsia2, hpNEAfrica, hpAfrica1 y hpAfrica2) y que se derivan de 6 líneas ancestrales. Sin embargo, la cepa moderna de H. pylori encontrada en la mayoría de los europeos se originó de la recombinación de dos poblaciones ancestrales. Europa Ancestral 1 y 2; Se ha sugerido que EA1 se originó en Asia Central donde evolucionó a hpAsia2, comúnmente encontrado en Asia del sur. Por otro lado, AE2 parece haber evolucionado en el noreste de África y se hibridizó con AE1 para convertirse en hpEurope. La zona exacta de la hibridación de las poblaciones de los progenitores y el verdadero origen de hpEurope son controversiales. Entre las hipótesis más aceptadas, se propone que la recombinación de AE1/AE2 podría haber ocurrido en el oeste asiático hace de 10,000 a 52,000 años que las cepas recombinantes fueron introducidas en Europa por los primeros humanos recolonizadores después de la última glaciación. En el estudio se analizaron 12 muestras de biopsias del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, una momia de 5300 años de la edad del cobre, buscando rastros de H.pylori, los análisis de isótopos estables mostraron que el hombre de hielo se originó y vivió en Europa del sur en los Alpes Italianos. El estómago del hombre de hielo fue descubierto buscando información radiológica y según lo que se encontró, contiene la comida que ingirió antes de morir. Las muestras de tejido utilizadas en el estudio provienen del estómago, tejidos mucosos y contenido de los intestinos delgado y grueso. Se determinó la presencia de H.pylori y se recontruyó todo su genoma con el uso de PCR y diagnósticos metagenómicos. El análisis metagenómico reveló ADN de H.pylori endógeno ancestral, con 15350 lecturas en todos los contenidos gastrointestinales. La distribución de las lecturas obtenidas a través del tracto intestinal es similar al H.pylori moderno encontrado en humanos, y también se encuentra en concentraciones decrecientes desde el estómago hasta el tracto intestinal bajo. También se encontró que el estómago del hombre de hielo estaba colonizado por una cepa citotóxica de H. pylori que desencadenó respuestas inflamatorias en el hospedero. Si el hombre de hielo sufrió enfermedades gástricas por la presencia de H.pylori, no se puede determinar únicamente observando la mucosa gástrica. En resumen se determinó en resultados de linaje que la cepa perteneciente al hombre de hielo pertenece a la cepa ancestral de hpAsia2 que es diferente de la cepa actual de hpAsia2 que se encuentra en el norte de la India. La similaridad genética de la cepa europea antigua implica que mucha de la diversidad presente en la edad de cobre se mantiene en la población hpEurope a pesar de la inserción posterior de AE2 en la población.
Karen Lizbeth Claro Mendoza Entre las principales características de la bacteria Helicobacter pylori se encuentra que esta es altamente recombinante, vive en el ambiente ácido del estómago humano, es una bacteria gramnegativa y se encuentra en la mitad de la población humana pero menos del 10% presenta las úlceras o carcinoma gástrico. Esta bacteria estomacal es una de las más prevalecientes en los humanos.
Si se registra el patrón que dibuja la filogeografía, se podrían reconstruir los éxodos humanos. La población bacteriana de Helicobacter pylori en la Europa actual (hpEurope), es un híbrido entre bacterias asiáticas y africanas, esto es un dato que ya se conocía; sin embargo se duda sobre cómo y cuándo se dio la hibridación.
hpEurope tiene dos ancestros, AE1 y AE2, de los cuales se ha sugerido que el primer ancestro AE1 proviene de Asia Central donde evolucionó en hpAsia2 la cual es encontrada comúnmente en el Sur de Asia. Mientras que el segundo ancestro AE2 señala que evolucionó en el noroeste de África y se hibridizó con AE1 para dar lugar a la actual hpEurope.
De la momia europea glaciar de cobre o “iceman” de 5300 años– que mediante análisis de isotopos estables se mostró que el hombre pudo haber vivido en el sur de Europa ene suroeste de los Alpes Italianos- se realizaron biopsias del tracto gastrointestinal Se llevó a cabo PCR, metagenómica y targeted genome capture; La metagenómica reveló que sí había Helicobacter pylory en las muestras del tracto digestivo y la alineación con el genoma de la actual bacteria Europea Helicobacter pylori, reveló que la muestra analizada es antigua.
Se obtuvo con el Multilocus Secuence Typing y otras técnicas de análisis, que el genoma de H. pylori de la momia se asemeja más a tres genomas de hpAsia2 provenientes de India. La baja presencia de AE2 (africana) indica que los grupos africanos migraron a Europa después de la Edad de cobre, lo cual es mucho más tiempo desúes de lo que estaba propuesto antes de lo estudio, si el iceman es representativo de la época de bronce.
Este artículo nos muestra la importancia de lasbacterias para el ser humano y cómo podemos aprovechar sus grandiosas características para descubrir la historia de la humanidad, en este caso algunos patrones de migración entre antiguos pobladores de África, Europa y Asia.
The 5300-year-oldHelicobacter pylorigenome of the Iceman
El estudio de la diversificación de la bacteria Helicobacter pylori puede permitirnos rastrear las rutas migratorias de los primeros humanos ya que es uno de los patógenos más prevalentes en los humanos (en la actualidad está presente en al menos el 50% de la población) además de que la transmisión se da principalmente por la vía intrafamiliar. La H. pylori actual es el resultado de la hibridación entre la cepa de Asia y la de África, sin embargo no hay consenso sobre la zona en la que se desarrolló tal hibridación, aunque hay una mayor probabilidad de que haya sido en Oriente Medio o en Asia occidental.
De los restos de un hombre de hielo de aproximadamente 5300 mil años (era de cobre de Europa) se extrajeron muestras de mucosa gástrica, de la cual se determinó la presencia y la secuencia (a través de PCR) de H. pylori. Se determinó que la abundancia de esta bacteria va disminuyendo conforme se baja en el tracto digestivo. El número de variantes genómicas de H. pylori en el tracto del hombre de hielo es ligeramente menor respecto al observado en los humanos de la actualidad.
Una variante del H. pylori se asocia con inflamación de la mucosa gástrica, y se encontró que la proteína específica que causa dicha inflamación (calproteína, CP) está presente tanto en los seres humanos actuales como en el hombre de la edad de hielo encontrado. Esta proteína se libera como reacción ante el ataque inmune del hospedero.
La H. pylori perteneciente al hombre de la edad de hielo encontrado comparte poca ancestría con las cepas del noreste de África y con las cepas de la Península Ibérica, mientras que la ancestría es alta con las cepas AE2. La H. pylori ancestral provee una primera evidencia de que la AE2 (de Europa Ancestral) existía ya en Europa Central en la edad de Cobre, a pesar de que en escasa medida. La baja hibridación de la cepa AE2 sugiere que la mayoría de su ancestría observada en Europa en la actualidad proviene de la evolución de ella misma, es decir, sin haberse sido mezclada con alguna cepa de otro origen.
Referencia Maixner, F. et al. (2016) The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351:6269, pp 162-165.
Omar Josue Obregón Portugal The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Este artículo plante la idea de que a través del uso de patrones filogeográficos en las bacterias, como la bacteria Helicobacter Pylori encontrada en una momia congelada de 5300 años de antigüedad, podemos reconstruir tanto las migraciones humanas recientes como las antiguas. La bacteria H. pylori, es una de las más dispersas en humanos a nivel mundial, estando en cerca de la mitad de la población mundial, de la cual solo el 10% desarrolla enfermedades, como ulceras y carcinomas gástricos. Pero observaciones en sus patrones filogeográficos sugieren que esta bacteria ha acompañado al humano por los últimos 100,000 años. Por lo tanto, la bacteria se ha utilizado como un marcador para el seguimiento de eventos demográficos complejos en la prehistoria humana. Un ejemplo de este uso práctico, es el hecho de que la H. pilory actual en poblaciones europeas es una hibridación de dos cepas ancestrales de diferente origen, la AE1 originada en el sur de Asia, y la AE2 originada en el norte de África. Lo que nos puede dar posibles ideas en la forma en la que ocurrió esta hibridación, demostrando así la compleja historia demográfica de los europeos. Sin embargo aún existen muchas dudas y especulaciones de donde y cuando ocurrió esta hibridación. Pero recientemente se ha sugerido que la combinación de la AE1 y la AE2 pudo haber ocurrido en Oriente Medio y Asia Occidental entre hace 10,000 y 52,000 años atrás. Y que las primeras cepas recombinantes se introdujeron en Europa con los primeros recolonizadores humanos después de la última glaciación. Esto se sabe gracias a las 12 biopsias aplicadas al tracto gastrointestinal de una momia congelada de 5,300 años de antigüedad, donde a través del uso de cadenas reactivas de polimerasas, diagnósticos metagenómicos, y capturas dirigidas de genomas se logró verificar la presencia de H. Pylori., además de reconstruir su genoma completo. Los estudios realizados al genoma de la H. pylori de esta momia del este de los Alpes Italianos, demostraron que guarda una gran similitud con aquellas de la parte central y sur de Asia, por lo que la bacteria encontrada está ligada más a ancestros asiáticos que puramente europeos. Lo que la convierte en una representante casi pura de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de ocurrir la hibridación con aquellas de origines africanos, demostrando así que la población africana llego a Europa apenas en los últimos miles de años. Este artículo me parece muy interesante ya que plante el uso de estudios biológicos para entender otras áreas que involucran a más ciencias, como la historia, la geografía, y la demografía, además de que nunca se me hubiera ocurrido que era posible estudiar las migraciones humanas a través del estudio de las bacterias o patógenos que nos utilizan como huéspedes.
La bacteria Helicobacter pylori es uno de los patógenos que más han prevalecido en el cuerpo humano. Este patógeno habita mayoritariamente en el estómago. Lo curioso de este patógeno es que como ha coexistido con los humanos durante varios miles de años, se pueden inferir migraciones humanas antiguas. Esta bacteria gram-negativa ha evolucionado para sobrevivir pese al medio ácido del estómago humano, y hoy en día esta bacteria está presente en alrededor de la mitad de la población humana, aunque aproximadamente solo un 10% de la población sufre de consecuencias graves como úlceras y tumores malignos en el estómago.
La bacteria actual es una híbrida entre una bacteria asiática y otra africana, pero se quiere saber el contexto en el que tuvo lugar esta hibridación. Para ello, se estudiaron las muestras de la biopsia de una momia apodada “The Iceman” (el hombre del hielo). Los análisis con isótopos estables muestran que este individuo vivió en el sur de Europa. Gracias a los diagnósticos metagenómicos, y a otras herramientas y estrategias de reconstrucción y secuenciación, se pudo determinar la presencia de H. pylori en el estómago de la momia.
Existe una gran controversia, ya que esta bacteria antigua ya estaba ligada a varios tipos de cepas relativamente distintas entre sí. Sin embargo, debido al tamaño mínimo de la muestra (n=1), es decir, que solamente se trabaja con el estómago de una sola momia, no se pueden hacer notables inferencias sobre el origen de esta híbrida actual.
El artículo me pareció bastante tedioso porque habla sobre muchos conceptos puntuales, como los tipos de cepas (AE1, AE2, etc). No obstante, me pareció muy interesante la relación que siempre ha existido entre el hombre y las bacterias, y cómo el estudio de estas pueden (en cierta manera) explicar migraciones y conductas pasadas.
Reyes Torres Anya Miranda
ReplyDeleteLa bacteria del estómago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos más frecuentes ya que ésta infecta el epitelio gástrico. Este patógeno se ha extendido globalmente, resultando en un patrón filogeográfico distinto que puede usarse para reconstruir migraciones humanas recientes y antiguas. En Europa se sabe que el H. Pylori es un híbrido entre las bacterias asiáticas y africanas, pero existen diferentes hipótesis sobre cuándo y dónde tuvo lugar ésta hibridación, lo que por ende nos refleja la compleja historia demográfica de los europeos. En este artículo presenta un H. Pylori de 5300 años de antigüedad. En una momia europea que se localizó en un glaciar, se encontró el genoma de un H. Pylori; esta es una muestra pura representativa de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de la hibridación; esto nos sugiere que la población africana llegó a Europa en los últimos miles de años.
Este patógeno ha evolucionado para poder subsistir en el medio ácido del estómago humano. Casi toda la población mundial porta esta bacteria en su estómago y por lo menos el 10% de los portadores desarrollan una enfermedad que se manifiesta como úlceras estomacales o carcinoma gástrico. Por lo tanto, la bacteria ha sido utilizada como marcador para rastrear eventos demográficos complejos en la prehistoria humana.
En este estudio, seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, que es una momia de edad de cobre de 5 300 años de antigüedad, en donde se encontró la presencia de H. Pylori. Los análisis de isótopos estables mostraron que el Iceman se originó y vivió en el sur de Europa, en el extremo oriental de Italia. Genéticamente, se parece más a los primeros europeos. El material de estudio incluía el contenido en el cuerpo, el tejido mucoso y el contenido del intestino delgado y del intestino grueso. Haciendo una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) directa, los diagnósticos metagenómicos y la captación del genoma dirigida, determinaron la presencia de H. Pylori y se reconstruyó su complejo genoma.
Demostraron que esta bacteria se originó cuando se recombinaron dos poblaciones ancestrales de Europa. Se cree que una de esas poblaciones se originó en Asia central y la otra parece haber evolucionado en el noreste de África, que en algún momento recombinaron en la versión europea actual.
Además, los resultados de nuestra ancestralidad indican que la cepa de Iceman pertenecía a una rama europea prehistórica de hpAsia2 (que son las distribuciones fitogeográficas) que es diferente de la población moderna de hpAsia2 del norte de la India. La gran similitud genética de la antigua cepa de la bacteria de Europa implica que gran parte de la diversidad presente en la Europa de la etapa de Cobre todavía se mantiene dentro de la población hpEuropa existente, a pesar de los milenios de la posterior introducción de AE2.
Con esto nos damos cuenta de que los humanos ya estábamos infectados con esta bacteria desde el comienzo de nuestra historia y que la evolución de H. pylori es que hubo dos cepas originales, una africana y otra asiática, que en algún momento se recombinaron para formar la actual cepa europea.
muy bien!
DeleteGuadalupe Mateos Pimentel
ReplyDeleteLa bacteria del estomago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos mas frecuentes. Se ha dispersado globalmente con su huésped humano dando como resultado un patrón filogeografico que puede usarse para reconstruir tanto las migraciones humanas recientes como antiguas. Aquí se presenta un genoma de H. pylori de 5300 años de edad de una momia Europea del glaciar de la era del cobre. El hombre de hielo H. pylori es antes de la hibridacion, lo que sugiere que la población africana llego a Europa dentro.
Hoy en día esta bacteria Gram-negativa se encuentra en casi la mitad de la población humana del mundo. La moderna cepa H. pylori encontrada en la mayoría de los europeos supuesta mente se origino de la recombinación de las dos poblaciones ancestrales Ancestral 1 y 2. Se seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal de esta momia-, esto mediante el uso directo de la reacción en cadena de la polimerasa , el diagnostico metagenomico, y la captura del genoma, se determino la presencia de H. pylori y se reconstruyo su genoma completo. Debido a las delaciones, el numero de variantes genomicas esta ligeramente por debajo del rango de lo que puede observarse entre as cepas modernas de H pylori.
El análisis secuencial posterior clasifico al H. pylori antigua, como una cepa tipo cagA-positivo vacA que ahora esta asociada con la inflamación de la mucosa gástrica. En total 22 proteínas observadas en el proteoma del estomago del Hombre de Hielo se expresan en neutrofilos y están implicadas en la respuesta del huésped inflamatorio. Por lo tanto el estomago del hombre de hielo fue colonizado por una cepa de tipo H. pylori cito-toxica resultado de la respuestas inmunes inflamatorias del huésped.
La antigua H. pylori del hombre de hielo se separo de las cepas modernas de hpEurope y su posición a lo largo de PCL estaba cerca de las cepas modernas de hpAsia2 de la India que reflejaban si AEi casi puro y sus ancestros AE2 muy bajos.
bien
DeleteEl genoma de pylori de Helicobacter de 5300 años del hombre de hielo
ReplyDeleteLa bacteria del estómago Helicobacter pylori es uno de los patógenos humanos más frecuentes. Y se ha dispersado globalmente con su anfitrión humano, dando por resultado un patrón filogeográfico distinto que puede utilizarse para reconstruir tanto recientes como antiguas migraciones humanas
El altamente patógeno recombinante Helicobacter pylori ha evolucionado para vivir en el ambiente ácido del estómago humano. Hoy en día, esta bacteria gram negativa se encuentra en aproximadamente la mitad la población del mundo humano, pero menos del 10% de los portadores desarrollan la enfermedad que se manifiesta como úlceras de estómago o carcinoma gástrico
El patógeno no sólo acompañó a los seres humanos modernos fuera de África, sino que también se ha asociado con su huésped durante al menos 100.000 años. Así, la bacteria se ha utilizado como un marcador de eventos demográficos complejos de seguimiento en la prehistoria humana. Cepas de pylori H. moderna han sido asignadas a poblaciones distintas según su origen geográfico
La cepa de pylori H. moderno encontrada en la mayoría de los europeos supuestamente se originó de la recombinación de las dos poblaciones ancestrales, la zona de hibridación precisa de las poblaciones parentales y el verdadero origen son polémicos
En este estudio, defendieron a 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del “hombre de hielo”, una momia 5300 años de edad del cobre, la presencia de H. pylori. Análisis de isótopos estables demostraban que se originó y vivió en el sur de Europa, en los Alpes italianos orientales. Genéticamente, se asemeja a los agricultores europeos tempranos
Mediante el uso directo de la polimerasa reacción en cadena (PCR), diagnósticos de metagenómica y genoma objetivo capturan la presencia de H. pylori y reconstruyen su genoma completo. La distribución a lo largo del tracto intestinal del hombre de hielo es similar a la de los seres humanos modernos del H. pylori positivos
Análisis de la secuencia subsecuente clasifica el antiguo H. pylori como una cepa de tipo s1a/i1/m1 vacA cagA-positivo que está ahora asociado con la inflamación de la mucosa gástrica. Así se concluye que el estómago del hombre de hielo fue colonizado por una citotóxica H. pylori – tipo tensión que activa la liberación de CP como consecuencia de la respuesta inmune inflamatoria del huesped. Sin embargo, si el hombre de hielo sufrió de enfermedad gástrica no puede determinar a partir de nuestro análisis debido a la pobre preservación de la mucosa del estómago
Además, nuestros resultados de ascendencia Co indican que la cepa del hombre de hielo pertenecieron a una rama europea prehistórica de hpAsia2 que es diferente de la población de hpAsia2 moderna del norte de la India. La alta semejanza genética de la cepa antigua a las bacterias de Europa implica que gran parte de la diversidad presente en la edad de cobre en Europa todavía se mantiene
bien!
DeleteMARÍA JOSÉ BELMONT GARCÍA
ReplyDeleteEste es un claro ejemplo de como la biología nos puede ayudar al estudio de otras áreas no sólo científicas, si no también históricas. Helicobacter pylori es un patógeno muy común presente en la raza humana que esta relacionado con la inflamación de la mucosa gástrica y puede brindarnos información sobre las migraciones que se han presentado en la historia, esta bacteria se clasifica según sus orígenes geográficos pero se cree que el tipo presente en Europa es un hibridación de la bacteria Asiática y Africana. Esta hibridación pudo haber ocurrido en el medio oriente de Asia entre hace 10,000 y 52,000. El hombre de hielo es una momia de 5300 años de antigüedad de la parte Sur de Europa, específicamente del Este de Italia, sirvió para demostrar estas teorías, se realizaron 12 biopsias en donde se encontró la presencia de H. Pylori en todos los tractos gastrointestinales y se reconstruyó su genoma. Se encontraron solo ligeras variaciones de las características de na bacteria actual pero también se encontró una estructura muy común de la parte centra y sur de Asia.
En resumen la bacteria encontrada en el hombre de hielo es mas cercana a ancestros asiáticos que puramente europeos. El llegar a conocer estos orígenes de las bacterias que se encuentran en nuestro organismo nos permite tener una mejor idea sobre las migraciones ocurridas en la historia de la humanidad e incluso nos remota a interacciones humanas que no se pensaban antes pero que hoy marcan la linea sobre la cual se presenta nuestro microbioma; las bacterias nos pueden ayudar a conocer nuestro futuro pero también conocer partes de la historia que no se sabían.
un poco corto
DeleteMérida Escudero Karla Daniela
ReplyDelete“The 5300-year-old Helicobacter pylori genome ofthe Iceman”
Uno de los patógenos más influyentes en el ser humano es la bacteria Helicobacter pylori que se encuentra en el estómago. Gracias al ser humano se ha dispersado globalmente.
En Europa la H. pylori es conocida por un ser hibrido entre las bacterias de Asia y África, sin embargo existen diferentes hipótesis sobre cuándo y donde tuvo lugar esta hibridación.
Se ha presentado un genoma de H. pylori de una momia glaciar europea de 5300 años de edad. El hombre de hielo tiene una H. pylori que es casi una representante pura de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de la hibridación.
H. pylori es un patógeno altamente recombinante que ha evolucionado para vivir en el ácido del estómago, es una bacteria Gramnegativa que se encuentra en aproximadamente la mitad de la gente.
La asociación de esta bacteria con los seres humanos da lugar a un patrón filogeografico así esta bacteria tiene utilidad como un marcador para el rastreo de eventos demográficos en la prehistoria humana.
Se realizó un estudio del hombre de hielo seleccionando 12 biopsias de su tracto gastrointestinal, este estudio mostro que el hombre de hielo se originó y vivió en el Sur de Europa. El estómago del hombre de hielo aun tenia restos de la comida que ingirió poco antes de su muerte esto fue material de estudio en conjunto con un tejido mucoso, contenido del intestino delgado y contenido del intestino grueso. Mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa y diagnósticos genómicos se determinó la presencia de H. pylori en su genoma completo.
Una secuenciación también arrojó que el H. pylori del hombre de hilo es una cepa que está asociada con la infamación de la mucosa gástrica por lo que el estómago del hombre de hielo fue colonizado por una H. pylori citotóxica como consecuencia de la respuesta inmune inflamatoria del huésped.
También gracias a esta información pudieron comparar esta bacteria con otras actuales buscando el origen de H. pylori.
bien!
DeleteCruz Vargas Erick Leonardo.
ReplyDeleteLa falta de conocimiento de algunas interacciones como a hibridación en H. Pylori entre bacterias asiáticas y africanas hace que la demografía se torne un tanto compleja, sin embargo, H. pylori, que se encontró en una momia de glaciar, muestra la existencia de población bacteriana de origen asiático por lo que se sugiere fue antes de la hibridación haciendo suponer que la población africana llegó después.
Éste patógeno debió evolucionar para poder vivir en el ambiente ácido del estómago, tanto ha sido su evolución que hoy en día se puede encontrar en aproximadamente la mitad de la población humana en el mundo, en los portadores que suelen desarrollar la enfermedad, se manifiesta con úlceras o carcinomas gástricos. La distribución filográfica de H. pylori ha sido predominantemente por transmisión intrafamiliar.
En cuanto a la recombinación e hibridación, su origen es controvertido, aún no se sabe con certeza en donde se originó, distintas frecuencias se han atribuido a eventos de poblamiento independientes que eventualmente se recombinaron con componentes ancestrales de H. pylori en Europa.
Con ayuda de la metagenómica se pudieron producir DNA endógeno de H. pylori en el tracto gastrointestinal y otras lecturas más llevaron a asimilarse a la de los humanos modernos, así mismo, los comparativos de todo el genoma confirmaron la similitud que tiene con el de la inda, lo que indica la diversidad en Europa del cobre y la Europa moderna a pesar del paso de los años.
muy corto...
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ReplyDeleteLópez Velázquez Nadia Saray
ReplyDeleteLa bacteria patógena gram negativa Helicobacter pylori es altamente recombinante y ha evolucionado para vivir en el ambiente ácido del estómago humano. Actualmente es uno de los patógenos más frecuentes presente en más de la mitad de la población humana, aunque menos del 10% de los portadores desarrollan una enfermedad que se manifiesta como úlceras estomacales o carcinoma gástrico. H pylori se ha distribuido globalmente junto con su hospedador humano como resultado de un patrón de distribución filogeográfico distinto. Precisamente por el hecho de que la bacteria haya acompañado a su hospedador durante al menos 100 000 años, permite su uso como marcador para el rastreo de eventos demográficos complejos en la prehistoria humana.
Las cepas modernas de H. pylori se han asignado a poblaciones según su origen geográfico (hpEurope, hpSahul, hpEastAsia, hpAsia2, hpNEÁfrica, hpAfrica1 y hpAfrica2) que son derivados de al menos 6 fuentes ancestrales. En el caso de hpEurope, la cepa actual encontrada en la mayoría de los europeos, supuestamente se originó de la recombinación de 2 poblaciones ancestrales (AE1 y AE2). Paralelo a esto se sugiere que AE1 tuvo su origen en Asia donde evolucionó a hpAsia2 que actualmente se encuentra en el sur de Asia. Pero por otro lado AE2 parece haber evolucionado del noreste de África y se posteriormente hibridarse con AE1 para convertirse en hpEurope, sin embargo la zona precisa de hibridación de las poblaciones parentales y el verdadero origen de dicha cepa son polémicos.
Recientemente se ha sugerido que la AE1/AE2 podría haber ocurrido en el Oriente medio o en Asia Occidental en un período de hace 10 000 a 52 000 años y que las cepas recombinantes fueron introducidas en Europa con los primeros recolonizadores humanos después del último glacial máximo.
En este artículo, se realizó un estudio donde se seleccionaron 12 muestras de biopsia del tracto gastrointestinal del “hombre de hielo” una momia de la Edad de Cobre con 5300 años de antigüedad y con la presencia de H. pylori. Los análisis de isotopos estables mostraron que el hombre de hielo se originó y vivió en el Sur de Europa, en los Alpes Italianos Orientales, genéticamente más parecido a los primeros agricultores. Su estómago fue descubierto en una evaluación de los datos radiológicos y contenía la comida que ingirió poco antes de su muerte. Dentro del material de estudio se incluyeron: el contenido del estómago, el tejido mucoso y el contenido del intestino delgado y grueso. Mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), diagnósticos metagenómicos y por captura de genoma dirigido, se determinó la presencia de H. pylori y se reconstruyó su genoma.
El análisis metagenómico arrojó DNA de H. pylori (15350 lecturas) en todos los contenidos del tracto gastrointestinal, las lecturas no ambiguas recuperadas se alinearon con un genoma de referencia moderno de H. pylori. El genoma de H. pylori del hombre de hielo tenía 43 000 Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y 39 deleciones. Además, como se esperaba para esta bacteria altamente recombinante, se encontró evidencia de inserciones de genes de cepas de H. pylori que difieren del genoma de referencia.
El estómago del hombre de hielo fue colonizado por una cepa de tipo H. pylori citotóxica que desencadenó la liberación de calprotectina como resultado de las respuestas inmunes inflamatorias del hospedador. Sin embargo, no es posible determinar si sufrió de una enfermedad gástrica.
La detección de una cepa hpAsia2 en el estómago del hombre de hielo es muy sorprendente ya que sólo se han encontrado 3 cepas de hpAsia2 en europeos modernos. La antigua cepa de H. pylori proporciona la primera evidencia de que AE2 ya estaba presente en el centro de Europa durante la edad del cobre pero en un nivel muy bajo, lo que sugiere que la mayor parte de la ascendencia de AE2 observado en hpEurope hoy en día es resultado de la introgresión posterior de AE2.
muy bien
DeleteSANCHEZ FUENTES ROCIO SARAHI
ReplyDeleteEl en articulo se explica el desarrollo de un estudio hecho sobre la bacteria: Helicobacter pylori de 5300 años de edad, encontrada en una momia europea. Debido a que es uno de los patógenos más frecuentes en el ser humano se hace una breve introducción explicando que esta bacteria es filogeográfica (acompaña al hombre en cualquier lugar) y altamente evolucionada, ya que se adapta a los ácidos del estomago y se encuentra en la mitad de la población del mundo; además de servir como marcador histórico en los eventos demográficos de la prehistoria, en regiones especificas y con ancestros comunes en cada lugar.
Se tiene una hipótesis de la recombinación de las especies ancestrales que dieron origen a la actual H pylori, entre una cepa Europea y otra Occidental, por lo que el nuevo descubrimiento sirvió de gran utilidad para esclarecer esta duda. Donde se uso directamente la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la captura del genoma objetivo, lo que dio paso a la reconstrucción de su genoma, siendo similar a la actual H. pylori (cepa 26695). Posteriormente se mejoro el ADN utilizando la captura de hibridación en solución, con lo que se obtuvieron ~ 43.000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y 39 supresiones que oscilaban entre 95 pares de bases (pb); y se encontró evidencia de inserciones de cepas de H. pylori que difieren del genoma de referencia.
Se clasifico a la cepa como tipo vacA s1a / i1 / m1 cagA-positiva, asociada con la inflamación de la mucosa gástrica, después de realizar comparaciones con cepas actuales y recombinadas se localizo una cepa diferente en la misma momia: la cepa hpAsia2, que está sumamente relacionada con tres genomas de la India; debido a que no se tiene una coincidencia más grande ,los científicos realizaron un análisis de alta resolución de los motivos ancestrales utilizando multaSTRUCTURE, lo que dio como resultado el compartimiento ancestral con la cepa moderna de AE2. Con ello se podría confirmas que esta cepa es desarrollada en la Europa antigua (edad de cobre); pero debido al tamaño de la muestra no puede hacerse una afirmación contundente; es necesario el análisis de mas cepas antiguas.
bien
DeleteSánchez Herrera Victoria Abigail
ReplyDeleteGenoma de Helicobacter pylori de 5300 años de edad
La bacteria patógena y altamente recombinante Helicobacter pylori es una de las más predominantes y globalmente dispersas, se encuentra en aproximadamente la mitad de la población humana, afortunadamente menos del 10% de los portadores desarrollan la enfermedad consistente en úlceras estomacales o carcinoma gástrico. Su distribución mundial al lado de los humanos junto con su alta tasa de recombinación genética ha generado un patrón filogeográfico que permite reconstruir migraciones humanas tanto recientes como antiguas.
La cepa moderna de Helicobacter pylori encontrada en la mayoría de la población europea (hpEurope) se originó de la recombinación de dos poblaciones ancestrales: AE1, que se cree se originó en Asia Central y AE2 que se originó en el noreste de África y generó a hpEurope por hibridación con AE1. El lugar preciso donde la hibridación ocurrió y el verdadero origen de hpEurope son controvertidos.
El artículo nos presenta un estudio de 12 biopsias del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, una momia de la era del cobre de 5300 años, que se originó y vivió en el sur de Europa, en los alpes italianos. Las biopsias incluían contenido estomacal, tejido de mucosa y contenidos del intestino delgado y grueso, y por medio de reacción en cadena de polimerasa, diagnóstico metagenómico, y captura dirigida del genoma se determinó la presencia de Helicobacter pylori y se reconstruyó su genoma completo. Se determinó que la momia sólo estaba infectada con una cepa de Helicobacter pylori, perteneciente a la población moderna hpAsia2 común en el centro y el sur de África y muy rara entre europeos. Análisis posteriores revelaron que esta cepa sólo contenía un 6.5% del componente ancestral AE2 DE hpEurope, lo cual implica que su ancestria es casi completamente de AE1. Desafortunadamente, la muestra con que se trabaja es insuficiente para obtener conclusiones acerca de la prevalencia de AE1 en la Europa antigua y de la introducción de AE2; sin embargo, sí provee evidencia de que AE2 se introdujo en Europa desde África tras la era de bronce, que es después de lo que se suponía .
Referencia
Maixner, F. et al. (2016) The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351:6269, pp 162-165.
bien!
DeleteEl altamente recombinante patógeno Helicobacter pylori se ha asociado con su hospedero (el humano) por al menos 100,000 años, evolucionó para vivir en el estómago humano y se encuentra en aproximadamente la mitad de la población. Es gracias a esto que la bacteria ha sido utilizada como marcador para hacer un seguimiento de los eventos demográficos en la prehistoria humana y rastrear las migraciones.
ReplyDeleteCepas actuales de H. pylori han sido asignadas a distintas poblaciones de acuerdo a su origen geográfico (hpEurope, hp.Sahul, hpEastAsia, hpAsia2, hpNEAfrica, hpAfrica1 y hpAfrica2) y que se derivan de 6 líneas ancestrales. Sin embargo, la cepa moderna de H. pylori encontrada en la mayoría de los europeos se originó de la recombinación de dos poblaciones ancestrales. Europa Ancestral 1 y 2; Se ha sugerido que EA1 se originó en Asia Central donde evolucionó a hpAsia2, comúnmente encontrado en Asia del sur. Por otro lado, AE2 parece haber evolucionado en el noreste de África y se hibridizó con AE1 para convertirse en hpEurope. La zona exacta de la hibridación de las poblaciones de los progenitores y el verdadero origen de hpEurope son controversiales. Entre las hipótesis más aceptadas, se propone que la recombinación de AE1/AE2 podría haber ocurrido en el oeste asiático hace de 10,000 a 52,000 años que las cepas recombinantes fueron introducidas en Europa por los primeros humanos recolonizadores después de la última glaciación.
En el estudio se analizaron 12 muestras de biopsias del tracto gastrointestinal del hombre de hielo, una momia de 5300 años de la edad del cobre, buscando rastros de H.pylori, los análisis de isótopos estables mostraron que el hombre de hielo se originó y vivió en Europa del sur en los Alpes Italianos. El estómago del hombre de hielo fue descubierto buscando información radiológica y según lo que se encontró, contiene la comida que ingirió antes de morir. Las muestras de tejido utilizadas en el estudio provienen del estómago, tejidos mucosos y contenido de los intestinos delgado y grueso. Se determinó la presencia de H.pylori y se recontruyó todo su genoma con el uso de PCR y diagnósticos metagenómicos.
El análisis metagenómico reveló ADN de H.pylori endógeno ancestral, con 15350 lecturas en todos los contenidos gastrointestinales. La distribución de las lecturas obtenidas a través del tracto intestinal es similar al H.pylori moderno encontrado en humanos, y también se encuentra en concentraciones decrecientes desde el estómago hasta el tracto intestinal bajo.
También se encontró que el estómago del hombre de hielo estaba colonizado por una cepa citotóxica de H. pylori que desencadenó respuestas inflamatorias en el hospedero. Si el hombre de hielo sufrió enfermedades gástricas por la presencia de H.pylori, no se puede determinar únicamente observando la mucosa gástrica.
En resumen se determinó en resultados de linaje que la cepa perteneciente al hombre de hielo pertenece a la cepa ancestral de hpAsia2 que es diferente de la cepa actual de hpAsia2 que se encuentra en el norte de la India. La similaridad genética de la cepa europea antigua implica que mucha de la diversidad presente en la edad de cobre se mantiene en la población hpEurope a pesar de la inserción posterior de AE2 en la población.
bien!
DeleteKaren Lizbeth Claro Mendoza
ReplyDeleteEntre las principales características de la bacteria Helicobacter pylori se encuentra que esta es altamente recombinante, vive en el ambiente ácido del estómago humano, es una bacteria gramnegativa y se encuentra en la mitad de la población humana pero menos del 10% presenta las úlceras o carcinoma gástrico. Esta bacteria estomacal es una de las más prevalecientes en los humanos.
Si se registra el patrón que dibuja la filogeografía, se podrían reconstruir los éxodos humanos. La población bacteriana de Helicobacter pylori en la Europa actual (hpEurope), es un híbrido entre bacterias asiáticas y africanas, esto es un dato que ya se conocía; sin embargo se duda sobre cómo y cuándo se dio la hibridación.
hpEurope tiene dos ancestros, AE1 y AE2, de los cuales se ha sugerido que el primer ancestro AE1 proviene de Asia Central donde evolucionó en hpAsia2 la cual es encontrada comúnmente en el Sur de Asia. Mientras que el segundo ancestro AE2 señala que evolucionó en el noroeste de África y se hibridizó con AE1 para dar lugar a la actual hpEurope.
De la momia europea glaciar de cobre o “iceman” de 5300 años– que mediante análisis de isotopos estables se mostró que el hombre pudo haber vivido en el sur de Europa ene suroeste de los Alpes Italianos- se realizaron biopsias del tracto gastrointestinal
Se llevó a cabo PCR, metagenómica y targeted genome capture; La metagenómica reveló que sí había Helicobacter pylory en las muestras del tracto digestivo y la alineación con el genoma de la actual bacteria Europea Helicobacter pylori, reveló que la muestra analizada es antigua.
Se obtuvo con el Multilocus Secuence Typing y otras técnicas de análisis, que el genoma de H. pylori de la momia se asemeja más a tres genomas de hpAsia2 provenientes de India. La baja presencia de AE2 (africana) indica que los grupos africanos migraron a Europa después de la Edad de cobre, lo cual es mucho más tiempo desúes de lo que estaba propuesto antes de lo estudio, si el iceman es representativo de la época de bronce.
Este artículo nos muestra la importancia de lasbacterias para el ser humano y cómo podemos aprovechar sus grandiosas características para descubrir la historia de la humanidad, en este caso algunos patrones de migración entre antiguos pobladores de África, Europa y Asia.
bien!
DeleteThe 5300-year-oldHelicobacter pylorigenome of the Iceman
ReplyDeleteEl estudio de la diversificación de la bacteria Helicobacter pylori puede permitirnos rastrear las rutas migratorias de los primeros humanos ya que es uno de los patógenos más prevalentes en los humanos (en la actualidad está presente en al menos el 50% de la población) además de que la transmisión se da principalmente por la vía intrafamiliar. La H. pylori actual es el resultado de la hibridación entre la cepa de Asia y la de África, sin embargo no hay consenso sobre la zona en la que se desarrolló tal hibridación, aunque hay una mayor probabilidad de que haya sido en Oriente Medio o en Asia occidental.
De los restos de un hombre de hielo de aproximadamente 5300 mil años (era de cobre de Europa) se extrajeron muestras de mucosa gástrica, de la cual se determinó la presencia y la secuencia (a través de PCR) de H. pylori. Se determinó que la abundancia de esta bacteria va disminuyendo conforme se baja en el tracto digestivo. El número de variantes genómicas de H. pylori en el tracto del hombre de hielo es ligeramente menor respecto al observado en los humanos de la actualidad.
Una variante del H. pylori se asocia con inflamación de la mucosa gástrica, y se encontró que la proteína específica que causa dicha inflamación (calproteína, CP) está presente tanto en los seres humanos actuales como en el hombre de la edad de hielo encontrado. Esta proteína se libera como reacción ante el ataque inmune del hospedero.
La H. pylori perteneciente al hombre de la edad de hielo encontrado comparte poca ancestría con las cepas del noreste de África y con las cepas de la Península Ibérica, mientras que la ancestría es alta con las cepas AE2. La H. pylori ancestral provee una primera evidencia de que la AE2 (de Europa Ancestral) existía ya en Europa Central en la edad de Cobre, a pesar de que en escasa medida. La baja hibridación de la cepa AE2 sugiere que la mayoría de su ancestría observada en Europa en la actualidad proviene de la evolución de ella misma, es decir, sin haberse sido mezclada con alguna cepa de otro origen.
Referencia
Maixner, F. et al. (2016) The 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman. Science 351:6269, pp 162-165.
Omar Josue Obregón Portugal
ReplyDeleteThe 5300-year-old Helicobacter pylori genome of the Iceman.
Este artículo plante la idea de que a través del uso de patrones filogeográficos en las bacterias, como la bacteria Helicobacter Pylori encontrada en una momia congelada de 5300 años de antigüedad, podemos reconstruir tanto las migraciones humanas recientes como las antiguas.
La bacteria H. pylori, es una de las más dispersas en humanos a nivel mundial, estando en cerca de la mitad de la población mundial, de la cual solo el 10% desarrolla enfermedades, como ulceras y carcinomas gástricos. Pero observaciones en sus patrones filogeográficos sugieren que esta bacteria ha acompañado al humano por los últimos 100,000 años. Por lo tanto, la bacteria se ha utilizado como un marcador para el seguimiento de eventos demográficos complejos en la prehistoria humana. Un ejemplo de este uso práctico, es el hecho de que la H. pilory actual en poblaciones europeas es una hibridación de dos cepas ancestrales de diferente origen, la AE1 originada en el sur de Asia, y la AE2 originada en el norte de África. Lo que nos puede dar posibles ideas en la forma en la que ocurrió esta hibridación, demostrando así la compleja historia demográfica de los europeos.
Sin embargo aún existen muchas dudas y especulaciones de donde y cuando ocurrió esta hibridación. Pero recientemente se ha sugerido que la combinación de la AE1 y la AE2 pudo haber ocurrido en Oriente Medio y Asia Occidental entre hace 10,000 y 52,000 años atrás. Y que las primeras cepas recombinantes se introdujeron en Europa con los primeros recolonizadores humanos después de la última glaciación. Esto se sabe gracias a las 12 biopsias aplicadas al tracto gastrointestinal de una momia congelada de 5,300 años de antigüedad, donde a través del uso de cadenas reactivas de polimerasas, diagnósticos metagenómicos, y capturas dirigidas de genomas se logró verificar la presencia de H. Pylori., además de reconstruir su genoma completo.
Los estudios realizados al genoma de la H. pylori de esta momia del este de los Alpes Italianos, demostraron que guarda una gran similitud con aquellas de la parte central y sur de Asia, por lo que la bacteria encontrada está ligada más a ancestros asiáticos que puramente europeos. Lo que la convierte en una representante casi pura de la población bacteriana de origen asiático que existía en Europa antes de ocurrir la hibridación con aquellas de origines africanos, demostrando así que la población africana llego a Europa apenas en los últimos miles de años.
Este artículo me parece muy interesante ya que plante el uso de estudios biológicos para entender otras áreas que involucran a más ciencias, como la historia, la geografía, y la demografía, además de que nunca se me hubiera ocurrido que era posible estudiar las migraciones humanas a través del estudio de las bacterias o patógenos que nos utilizan como huéspedes.
bien!
DeleteAntal Moreno Espinosa
ReplyDeleteLa bacteria Helicobacter pylori es uno de los patógenos que más han prevalecido en el cuerpo humano. Este patógeno habita mayoritariamente en el estómago. Lo curioso de este patógeno es que como ha coexistido con los humanos durante varios miles de años, se pueden inferir migraciones humanas antiguas. Esta bacteria gram-negativa ha evolucionado para sobrevivir pese al medio ácido del estómago humano, y hoy en día esta bacteria está presente en alrededor de la mitad de la población humana, aunque aproximadamente solo un 10% de la población sufre de consecuencias graves como úlceras y tumores malignos en el estómago.
La bacteria actual es una híbrida entre una bacteria asiática y otra africana, pero se quiere saber el contexto en el que tuvo lugar esta hibridación. Para ello, se estudiaron las muestras de la biopsia de una momia apodada “The Iceman” (el hombre del hielo). Los análisis con isótopos estables muestran que este individuo vivió en el sur de Europa. Gracias a los diagnósticos metagenómicos, y a otras herramientas y estrategias de reconstrucción y secuenciación, se pudo determinar la presencia de H. pylori en el estómago de la momia.
Existe una gran controversia, ya que esta bacteria antigua ya estaba ligada a varios tipos de cepas relativamente distintas entre sí. Sin embargo, debido al tamaño mínimo de la muestra (n=1), es decir, que solamente se trabaja con el estómago de una sola momia, no se pueden hacer notables inferencias sobre el origen de esta híbrida actual.
El artículo me pareció bastante tedioso porque habla sobre muchos conceptos puntuales, como los tipos de cepas (AE1, AE2, etc). No obstante, me pareció muy interesante la relación que siempre ha existido entre el hombre y las bacterias, y cómo el estudio de estas pueden (en cierta manera) explicar migraciones y conductas pasadas.