Wednesday, September 14, 2016

8. Carol Potera 2016. Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life. Microbe: 11, 7 pp 292 9.

43 comments:

  1. FRANCO FLORES EMMANUEL
    En esta investigación, nos demuestra que la organización de las diferentes especies que pueblan nuestro planeta en términos de diversidad está muy lejos de lo que cualquiera de nosotros pudiera imaginar.
    El llamado árbol de la vida donde se muestran las diferentes especies que han habitado nuestro entorno tiene grandes sorpresas, el último de éstos nos presenta muchas divisiones, pero sorprendentemente muy pocas las ocupan los llamados súper grupos, (eucariotas, con solamente 5 divisiones o líneas), las demás están ocupadas por el phylo Arquea (con 26) y el phylo Bacteria, (con 92)… ¿a dónde nos conduce esto?, a reconocer que las bacterias dominan toda la biología si de diversidad se habla.
    Se utilizó un reconstructor de secuencia del genoma para identificar a las bacterias, algunas ni siquiera se han visto, así, con este nuevo árbol de la vida tenemos información de sobra para futuras investigaciones, ya sea de evolución, microbiología o diversidad biológica, reconociendo la publicación de estos datos de manera abierta por parte de los investigadores (Banfield y colaboradores).
    Y aunque este árbol seguramente no será el último, nos muestra la cantidad de diversidad que hemos perdido a lo largo de la Historia, a pesar de los notables avances tecnológicos.
    Casi la mitad de las bacterias en la rama dominante, cuyos miembros tienen genomas pequeños y vida simbiótica; aunque se sabe muy poco de los estilos de vida y el metabolismos de las bacterias que pertenecen a este grupo, se pueden identificar en ellos genes que pudieran replicar ADN y producir proteínas, sin embargo, aquellos que tienen estas características no completan el ciclo del ácido cítrico, no tienen cadenas respiratorias y no pueden sintetizar nucleótidos.
    Al ser un grupo de una extensión y diversidad extraordinaria podría en un futuro considerarse como un phylo.
    Así que se basan en la fermentación para su energía metabólica y obtienen derivados básicos desde otros organismos.
    A pesar de estas deficiencias tenemos una gran diversidad en este grupo.
    En resumen, este es un avance muy importante ya que este nuevo grupo abre nuevas perspectivas, nos demuestra la enorme diversidad que existe en la naturaleza y un estudio más detallado sobre su evolución y su bioquímica pueden explicar en gran parte el metabolismo de los seres vivos en los inicios de la vida.

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  2. Teresa Guadalupe Mateos Pimentel.

    La idea general de este artículo radica en la gran diversidad de diferentes especies que se muestran el la nueva versión del árbol de la vida basándose en la gran rama de las bacterias y también se basa en las bacterias que pertenecen a Candidate Phyla Raiation.
    El nuevo árbol de la vida muestra animales, plantas y hongos en dos ramas pequeñas, mientras que las bacterias ocupan la mayor rama. Sin embargo la mayoría de estas bacterias no se han visto. Estas bacterias se has identificado utilizando reconstrucción de secuencias de genoma. El articulo explica que el análisis filogenético se baso en un conjunto de secuencias de 16s proteína ribosomal y en 16s rRNA, de acuerdo con el investigador Banfield.
    Poco se sabe de los estilos de vida metabolicos de los miembros que perteneces a Cadidation Phyla Radiation, cuyos miembros se caracterizan por tener genomas pequeños y por tener estilos de vida simbióticos. Dichos miembros no completan el ciclo de acido cítrico, no tiene cadenadas respiratorias y no pueden sintetizar nucleótidos, a pesar de que identifican en ellos genes que pueden replicar DNA y producir proteínas, por lo que menciona el articulo que es probable que estos miembros se basen en la fermentación para obtener su energía metabólica.
    El nuevo árbol de la vida tiene implicaciones para una mejor comprensión de la evolución, l diversidad funcional, los requisitos generales de los sistemas de vida y nuevos estudios de la diversidad microbiana, dice Eisen. Por otra parte el análisis la ecología, evolución y bioquímica de los miembros de Cadidation Phyla Radiation puede proporcinar pistas sobre el metabolismo de los organismos de los primero años de vida.

    Este articulo me gusto mucho ya que muestra la gran diversidad de especies que existe y la sorprendente diversidad de bacterias que hay y aun mas que como lo menciona el articulo muchas de ellas no han sido vitas por lo que concluyo que el estudio de la diversidad de baterías es muy complejo pero a su vez dota de una gran conocimiento y un gran avance del desarrollo de la vida y de otras aplicaciones.

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  3. López Velázquéz Nadia Saray

    Bacterial diversity is dominant feature in new tree of life.
    En esta nueva versión del árbol de la vida, los investigadores de la Universidad de California nos muestran como las bacterias dominan a la biología en cuanto a diversidad. Muchos de estos organismos que a pesar de que no se han logrado ver, se han podido identificar mediante las secuencias del genoma. Resulta sorprendente la escala masiva de las bacterias que abarcan aquellos linajes que carecen de representaciones aisladas, mostrando así el amplio alcance de los linajes desconocidos.
    El análisis filogenético efectuado se basó en un conjunto de secuencias de la proteína ribosomal 16S, además de datos de 16S rRNA. Conforme a ello, en la nueva organización representada en el árbol, las bacterias se posicionan en la rama principal, en comparación con los animales, plantas y hongos, que ocupan sólo dos pequeñas ramas, con lo que nos lleva a pensar sobre lo que será necesario para saber sobre la diversidad filogenética de los genomas de bacterias y arqueas.
    Un caso muy interesante es el del supergrupo Candidate Phyla Radiation, que comprende la mitad de la nueva rama dominante. Los miembros de este grupo tienen características particulares, tales como genomas pequeños y estilos de vida simbióticos (estilos que impiden la aislación de organismos). Por otro lado, entre lo que se sabe acerca de sus vías metabólicas, es que pueden replicar DNA y producir proteínas. Entre las deficiencias metabólicas se puede mencionar la falta del ciclo del ácido cítrico, de cadenas respiratorias y de capacidades para sintetizar, se cree que se basan en la fermentación para su energía metabólica.
    Esta nueva versión de una de las representaciones organizacionales más importantes en la biología nos lleva a pensar en la enorme variedad y evolución de la vida en la Tierra. El comprender esta amplia gama microbiana tiene un papel fundamental en la ecología microbiana, la genética y la historia de la vida. Y con ello se plantean nuevas incógnitas, como la variedad en las funciones microbianas o hacia dónde dirigir los estudios de esta diversidad. Sin duda, para lograr todo el conocimiento posible, debemos hacer uso de los avances tecnológicos convenientes.

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  5. MÉRIDA ESCUDERO KARLA DANIELA

    “Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life”

    Ahora existe una nueva versión del árbol de la vida. Este árbol propone mediante una imagen como es que las bacterias dominan toda la biología en términos de diversidad. El análisis filogenético está basado en secuencias que se producen constantemente de la proteína 16S.
    En éste árbol, las plantas, los animales y lo hongos salen de dos ramas pequeñas lo que conduce a que las bacterias son las que ocupan la mayor rama. Según Jonathan Eisenat de la Universidad de Californa esté nuevo árbol ofrece información necesaria de lo que se conoce de la diversidad filogenética de bacterias ya que muetra la relevancia de los enfoques genómicos de resulicion temporal donde detaca la vida microbiana por lo que añade que posiblemente no es el final, si es que alguna vez haya uno.
    Se sabe muy poco acerca de los estilos de vida, especialmente respecto al metabolismo, de las especies bacterianas que pertenecen al Candidate Phyla Radiation porque las especies que caen dentro de esta radiación no tienen los genes para completar el ciclo del ácido cítrico, cadenas respiratorias y las capacidades de sintetización de nucleótidos por lo que se cree que se basan en la fermentación para obtener energía metabólica.
    Sin embargo, gracias a esta representa con obtenernos un análisis más detallado de la ecología, evolución y bioquímica de las bacterias.
    Con lo visto en clase entendí mejor este artículo además de que me parece sorprendente como de algo que parece sencillo podemos obtener tanta información sobre lo que hoy existe y lo que alguna vez existió. También es interesante como pareciera que somos prácticamente nada en el universo de las bacterias.

    Potera C. (2016). "Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life."

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  6. SANCHEZ FUENTES ROCIO SARAHI
    El artículo se centra en el árbol de la vida, en el cual se muestra desde lo más pequeño (unicelular) hasta lo más grande (pluricelular); donde el reino de las bacterias ocupa la mayor extensión del mismo. Con los nuevos descubrimientos que se han hecho en el reino bacteria, se incluyen 92 nuevos nombres en el filo, al igual que en el reino arquea se anexaron 26 nombres; gracias a esto se podrá explicar de una mejor manera la evolución de los organismos y su surgimiento en la tierra, así como la diversidad genómica que cada microorganismo presenta y su respectivo desarrollo.
    Aunque el árbol de la vida está lleno de diversidad no significa que sea el final o que este completo, ya que todavía faltan muchas bacterias por conocer a fondo, así como las nuevas especies que van surgiendo. Por ejemplo, debido a que todas las bacterias presentan variaciones en su genoma, surgen deficiencias metabólicas en algunas, lo que impide conocer con claridad su desarrollo; por lo que algunas cosas solo se presuponen.
    En mi opinión el árbol de la vida es un gran plano que nos facilita y nos ayuda a comprender y ordenar toda la vida que ha surgido desde que se dieron las condiciones aptas para la vida y su desarrollo; es muy importante para las investigaciones y experimentos que se hacen en los laboratorios. Nos dan un paso más en el conocimiento de la evolución, así como aquello que estuvo antes de la vida.

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  7. TOVAR HERNÁNDEZ AMANDA SOFÍA
    La diversidad bacteriana es el tema dominante en el nuevo árbol de la vida
    El nuevo árbol de la vida incluye 92 phyla de bacterias nombradas, 26 phyla de bacterias y los 5 súper grupos de eukariotas. Este nuevo árbol remarca como las bacterias dominan a la biología en cuanto al tema de la diversidad. Pero pese a esto muchas de las más abundantes bacterias nunca han sido vistas solo han sido identificadas usando secuencias de genoma reconstruido
    El análisis filogenético depende de un grupo de proteínas ribosomales 16S. Este nuevo árbol muestra como los animales plantas y hongos son agrupados en tan solo dos pequeñas ramas mientras que en contraste, las bacterias ocupan la rama mayor.
    Este nuevo acomodo tiene implicaciones para un mejor entendimiento evolutivo, así como de la diversidad funcional de los microbios y los requerimientos generales para los sistemas vivos. Aunque el artículo habla sobre el descubrimiento de muchas nuevas bacterias también menciona que pese a toda la tecnología que tenemos hoy en día mucha de la diversidad en bacterias falta por ser descubierta.
    En conclusión este nuevo árbol de la vida muestra una mucho mejor y nueva imagen acerca de lo que es conocido acerca de la diversidad filogenética en bacterias y en el genóma de arqueas, lo cuál en mi opinión resulta algo de suma importancia, ya que normalmente tenemos una idea del árbol de la vida donde animales, plantas y hongos ocupan ramas de similar tamaño, pero creo que es un tema realmente necesario el de hacer notar que las bacterias tienen una variedad impresionante y mucho mayor a la que la mayoría seguramente piensa. Es por eso que me encantó este artículo del nuevo árbol de la vida

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  8. TOVAR HERNÁNDEZ AMANDA SOFÍA
    La diversidad bacteriana es el tema dominante en el nuevo árbol de la vida
    El nuevo árbol de la vida incluye 92 phyla de bacterias nombradas, 26 phyla de bacterias y los 5 súper grupos de eukariotas. Este nuevo árbol remarca como las bacterias dominan a la biología en cuanto al tema de la diversidad. Pero pese a esto muchas de las más abundantes bacterias nunca han sido vistas solo han sido identificadas usando secuencias de genoma reconstruido
    El análisis filogenético depende de un grupo de proteínas ribosomales 16S. Este nuevo árbol muestra como los animales plantas y hongos son agrupados en tan solo dos pequeñas ramas mientras que en contraste, las bacterias ocupan la rama mayor.
    Este nuevo acomodo tiene implicaciones para un mejor entendimiento evolutivo, así como de la diversidad funcional de los microbios y los requerimientos generales para los sistemas vivos. Aunque el artículo habla sobre el descubrimiento de muchas nuevas bacterias también menciona que pese a toda la tecnología que tenemos hoy en día mucha de la diversidad en bacterias falta por ser descubierta.
    En conclusión este nuevo árbol de la vida muestra una mucho mejor y nueva imagen acerca de lo que es conocido acerca de la diversidad filogenética en bacterias y en el genóma de arqueas, lo cuál en mi opinión resulta algo de suma importancia, ya que normalmente tenemos una idea del árbol de la vida donde animales, plantas y hongos ocupan ramas de similar tamaño, pero creo que es un tema realmente necesario el de hacer notar que las bacterias tienen una variedad impresionante y mucho mayor a la que la mayoría seguramente piensa. Es por eso que me encantó este artículo del nuevo árbol de la vida

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  9. Reyes Torres Anya Miranda

    La diversidad bacteriana es una característica dominante en nuestro árbol de vida.
    Y una versión nueva incluye 92 filas bacterianas, 26 filos de arqueas, y los cinco de los supergrupos eucariotas.Este árbol domina toda la biología de la diversidad. Por otra parte, se identificaron muchas bacterias abundantes que nunca se habían visto, utilizando secuencias del genoma reconstruidas. "Fue una sorpresa ver la escala masiva de la diversidad en el dominio Bacteria, incluyendo sus muchos linajes representantes aislados,"
    El análisis filogenético se basó en un conjunto de secuencias de la proteína ribosomal, así como datos de 16S rRNA -es un componente de la subunidad 30S de los ribosomas procariontes-. Un punto fuerte es que estos genes 16S se producen constantemente muy cerca del genoma. Este nuevo árbol muestra animales, plantas y hongos acumulados en dos ramas pequeñas, y las bacterias ocupan la rama más grande. El nuevo árbol de la vida ofrece una imagen muy necesaria de lo que se conoce acerca de la diversidad filogenética de los genomas de bacterias y arqueas. Tiene implicaciones para una mejor comprensión de la evolución, la diversidad funcional de los microbios, la dirección de muchos métodos utilizados para estudiar la diversidad microbiana, los requisitos generales de los sistemas vivos, y sentido para nuevos estudios de la diversidad microbiana. Esta última representación del árbol de la vida probablemente no es el final, de hecho dudo que alguna vez haya uno. Tal vez pueda existir uno, pero está muy lejos de nuestro alcance por el momento. Pero muestra cuánta diversidad nos hemos perdido, a pesar de nuestra notable tecnología. Aproximadamente la mitad de las bacterias de la rama dominante del nuevo árbol pertenecen al Candidato Phyla(radiación). Pero casi no sabemos nada sobre estos miembros de este supergrupo que se está describiendo, en dónde sus miembros se caracterizan por tener genomas pequeños. De hecho se sabe muy poco sobre los estilos de vida metabólica de las especies de bacterias que pertenecen al candidato Phyla la radiación. Sus genomas contienen muchos genes reconocibles y compatibles con sus vías metabólicas para la replicación de ADN y la producción de proteínas. Sin embargo, las especies que caen con la radiación en este, carecen de los genes para completar el ciclo del ácido cítrico, cadenas respiratorias, y las capacidades de sintetización de nucleótidos.
    Por lo tanto, es probable que se basen en la fermentación para su energía metabólica y deriven algunos de sus bloques de construcción básicos de otros organismos. Pero a pesar de esas muchas deficiencias metabólicas, hay una enorme diversidad con este candidato.
    Los microorganismos son esenciales para la diversidad biológica y sin ellos ningún ecosistema podría existir. El 50% de la biomasa del planeta es microbiana. Sin embargo conocemos muy poco sobre estas especies y su diversidad funcional y nuestras ideas sobre su papel y su influencia en los ecosistemas están basadas en información muy incompleta. Nuestra comprensión sobre su diversidad ofrece muchos beneficios científicos y tecnológicos. Una mejor comprensión ampliará nuestros conocimientos y mejoraría nuestro concepto sobre la vida.

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  10. MARÍA JOSÉ BELMONT GARCÍA
    Este texto habla sobre la nueva edición del árbol de la vida en el cual se puede ver claramente como las bacterias dominan a los demás organismos en términos de especie, básicamente de lo que se habla en este texto es de los esfuerzos que se han realizado para poder presentar este árbol ya que a pesar de que no todas estas especies se conocen formalmente, se han encontrado gracias a técnicas de secuenciación de ADN como las 16S rRNA. Algo que me fascinó tal sólo de ver el árbol de la vida, ha sido la notable pequeñez que abarca la diversidad de animales, plantas y hongos ya que es todo lo que podemos ver que nos rodea, lo que me lleva a pensar en toda esa diversidad que no conocemos, muchas veces se cree que ya hay pocas cosas por descubrir pero como hemos visto en lo que lleva del curso hay ciertas cosas que ni siquiera se han llegado a estudiar, hablemos de la anatomía de estas bacterias en principio de las cuales no se puede conocer debido a que no pueden crecer en condiciones formales de la laboratorio para facilitar su estudio y aún más desconocido su funcionamiento, sus rutas metabólicas de las cuales si se tuviera conocimiento se podría utilizar para desarrollar nuevas tecnologías.

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  11. Victoria Abigail Sánchez Herrera

    Nuevo árbol de la vida se enfoca en la diversidad bacteriana

    Este nuevo árbol de la vida incluye 92 filos de bacterias, 26 de arqueas y los 5 supergrupos eucariotas. Debido a que la mayoría de bacterias no pueden ser cultivadas, éstas fueron identificadas mediante la reconstrucción de secuencias genómicas.

    Como apunta Jonathan Eisen, este árbol pone en perspectiva nuestro conocimiento sobre la diversidad filogenética de bacterias y arqueas y tiene implicaciones en el mejor entendimiento de la evolución, la diversidad funcional de los microbios y los sesgos en los métodos disponibles para el estudio de la diversidad microbiana; también nos muestra dónde podemos centrar nuevos estudios sobre dicha diversidad.

    Un grupo de bacterias recientemente descrito y por ahora nombrado “Candidate Phyla Radiation” forma una gran parte de la porción de bacterias del nuevo árbol, y es un muy buen ejemplo de lo poco que conocemos acerca de la diversidad bacteriana, ya que sólo se ha aislado a un miembro del grupo y uno más ha logrado ser cultivado en conjunto con otra bacteria. Como características generales del grupo, se sabe que tienen genomas pequeños, que viven en simbiosis y, según indican sus genes, que probablemente usen la fermentación para obtener energía y obtengan sus moléculas estructurales básicas de otros organismos.

    Así pues, este nuevo árbol de la vida nos permite tener una visión más amplia sobre la diversidad de bacterias y arqueas, y a pesar de que esto constituye un gran avance también nos muestra lo mucho que nos queda por descubrir según se vayan desarrollando nuevas tecnologías.

    Referencias
    Potera, C. (2016). Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life.Microbe: 11, 7 p.292

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  12. Karen Lizbeth Claro Mendoza

    El árbol de la vida está dominado por las bacterias. El último árbol registra 92 bacteria phyla nombrados, 26 arquea phyla, y todas las 5 de los supergrupos eucariotas. Sin embargo, solo se ha estudiado una pequeña parte del mundo bacteriano, nunca se han visto o logrado aislar debido al desconocimiento detallado de las condiciones que necesitan para vivir.

    En la imagen que se presenta en este artículo, se puede apreciar que el dominio Eukarya al que somos pertenecientes ocupa una pequeñísima parte del árbol filogenético de la vida.

    Se sabe que existen muchos organismos dentro del dominio Bacteria ya que se han identificado mediante reconstrucciones de secuencias genómicas.

    La filogenia es el estudio de la evolución y desarrollo de las especies. La comparación de secuencias de algunas macromoléculas, es la forma más precisa y confiable para inferir en las relaciones filogenéticas.

    El gen 16s, ha sido de mucha ayuda para los taxónomos microbianos, sin embargo, no siempre resulta una comparación efectiva ya que a veces las variaciones son demasiado pequeñas entre las diversas especies bacterianas.

    Y como comenta A. Murat Eren, que la última imagen del árbol de la vida, no será la último, si alguna vez hay una. Pero esto muestra cuanta diversidad no se conoce, a pesar de las notables brechas tecnológicas.

    Se debe seguir poniendo especial atención en el estudio de la gran diversidad de bacterias, ya que estas nos podrían revelar los misterios de la vida que se han buscado durante siglos.

    Potera C (2016). Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life. Microbe: 11, 7 pp 292 9.

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  13. Joselin Judith Peña Herrera.
    Diversidad Bacterial Es Rasgo Dominante en Nuevo Árbol de la Vida.

    Es importante saber que en este árbol dominan las bacterias en términos de diversidad; esto da paso a que muchas de las bacterias nunca hayan sido vistas, ni siquiera que sepan como funciona su metabolismo, solo se han basado utilizando secuencias de genoma reconstruidas, ellos confiaron en el juego de 16 ribosomal secuencias de proteínas para poder clasificar a las especies en este nuevo árbol, en el que muestran animales, plantas, y hongos atestados en dos pequeñas ramas, mientras que las bacterias ocupan la rama principal que esta muy ramificada por lo mismo que es mas dominante; pero algo importante dentro de esta rama de bacterias es que aproximadamente la mitad pertenecen a la Radiación de Fílums de Candidato, de los cuales no se sabe mucho sobre los modos de vivir metabólicos que tienen, a pesar de eso hay mucha diversidad en esta rama y con los análisis debidos se podrían proporcionar pistas sobre la plataforma metabólica de temprana vida, debido a que tiene que existir primero un predecesor para que exista un descendiente.
    Es muy probable que esta forma que hoy tiene el árbol de vida sea cambiada, porque a mi parecer si no se conocen muchas de las bacterias que fueron reconstruidas no tiene sentido ponerlas en esta clasificación porque tampoco se conoce como es su metabolismo y tal vez puedan ser diferentes y no deberían estar incluidas en esta rama tan grande tal vez pueda existir una que derive de esta en la que se podrían encontrar.

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  14. Karen Lizbeth Claro Mendoza

    El árbol de la vida está dominado por las bacterias. El último árbol registra 92 bacteria phyla nombrados, 26 arquea phyla, y todas las 5 de los supergrupos eucariotas. Sin embargo, solo se ha estudiado una pequeña parte del mundo bacteriano, nunca se han visto o logrado aislar debido al desconocimiento detallado de las condiciones que necesitan para vivir.

    En la imagen que se presenta en este artículo, se puede apreciar que el dominio Eukarya al que somos pertenecientes ocupa una pequeñísima parte del árbol filogenético de la vida.

    Se sabe que existen muchos organismos dentro del dominio Bacteria ya que se han identificado mediante reconstrucciones de secuencias genómicas.

    La filogenia es el estudio de la evolución y desarrollo de las especies. La comparación de secuencias de algunas macromoléculas, es la forma más precisa y confiable para inferir en las relaciones filogenéticas.

    El gen 16s, ha sido de mucha ayuda para los taxónomos microbianos, sin embargo, no siempre resulta una comparación efectiva ya que a veces las variaciones son demasiado pequeñas entre las diversas especies bacterianas.

    Y como comenta A. Murat Eren, que la última imagen del árbol de la vida, no será la último, si alguna vez hay una. Pero esto muestra cuanta diversidad no se conoce, a pesar de las notables brechas tecnológicas.

    Se debe seguir poniendo especial atención en el estudio de la gran diversidad de bacterias, ya que estas nos podrían revelar los misterios de la vida que se han buscado durante siglos.

    Potera C (2016). Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life. Microbe: 11, 7 pp 292 9.

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  15. SABINA YETLANEZI SÁNCHEZ OLIVERA
    Las bacterias son los seres vivos más abundantes y diversos en el planeta, con metabolismos adaptados prácticamente a todo que les permiten vivir en todo tipo de ambientes, a pesar de esto, no sabemos mucho acerca de una gran cantidad de ellas , e incluso muchas de las bacterias más abundantes no han logrado ser vistas, o cultivadas.

    Recientemente se logró describir el supergrupo (al que casi la mitad de las bacterias de la rama dominante del árbol de la vida pertenecen) Candidate Phyla Radiation, linaje que no ha sido visto y del cual ha sido imposible hacer cultivos, pero se pudo identificar gracias a la tecnología, la cual ayudó a reconstruir la secuencia de sus genes del ribosoma 16s, así como del RNA ribosomal 16s (mediante análisis metagenómicos), los cuales están siempre próximos en el genoma. Esto fue lo que permitió identificarlas y nombrarlas, y ahora forman parte de los 92 phyla de bacteria presentes en el árbol de la vida, el cual en su mayor parte está conformado por especies de bacterias.


    Estas bacterias se caracterizan por tener genomas pequeños y por ser organismos simbióticos, de los cuales no se conoce mucho acerca de su metabolismo, sin embargo, gracias a la meta genómica que se utilizó para secuenciar los genes antes mencionados, se encontró en su DNA que carecen de ciertos genes para completar los ciclos del ácido cítrico, cadenas respiratorias y ciertas habilidades sintetizadoras del núcleo. Debido a este descubrimiento se cree que podrían ser bacterias que obtienen su energía a partir de la fermentación y que obtienen sus nutrientes esenciales de otros organismos, también se cree que el estudio de su ecología, evolución y bioquímica podrían brindar algunas pista acerca de la plataforma bioquímica de la vida temprana, sin embargo, a pesar de la falta de estos genes importantes para el metabolismo del resto de los seres vivos, hay una gran diversidad dentro de este supergrupo recién descrito.

    A pesar de que las bacterias conforman el dominio más grande del árbol de la vida, aún desconocemos muchas bacterias y aún de las ya identificadas, es difícil entender su metabolismo y todo lo involucrado en estas reacciones que les permiten vivir y formar parte importante de la ecología mundial. Nuestra ignorancia en cuanto a la diversidad de bacterias nos hace ver que son necesarios distintos tipos de investigaciones para aprender más acerca de evolución, diversidad y metabolismo de las bacterias, y que a pesar de ser los seres más antiguos y abundantes del plantea e incluso a pesar de lo mucho que ha avanzado la tecnología en los últimos años, no hemos sido capaces de identificar a muchas de ellas.

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  16. Gariglio Rangel Aldo Fabián

    Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life

    Las bacterias son las campeonas de la diversidad, pues cuentan con 92 filias, en comparación con las arqueas que tienen 26, y respecto de los eucariontes, que tiene sólo 5. Aunque las bacterias más abundantes no pueden verse, se puede reconstruir su genoma por secuenciación. La proteína ribosomal S16 ha sido la base para establecer dichas ramas filogénicas. Estos estudios pueden servir para entender mejor la evolución, la diversidad funcional de los microbios, los sesgos en los métodos usados para analizar la diversidad microbiana, los requerimientos generales de los sistemas vivos, y dónde enfocar los esfuerzos para los nuevos estudios sobre diversidad microbiana.

    Con dichas tecnologías se ha podido constatar que la diversidad biológica es mucho más amplia de lo que se imaginaba, y que seguramente a pesar de los avances quedarán muchas especies por descubrir. Por ejemplo, se ha descrito recientemente a un supergrupo denominado Candidate Phyla Radiation, del cual se sábe únicamente que no completan el ciclo del ácido cítrico sino que se basan en la fermentación para obtener energía, y se apoyan en varios procesos que realizan otros organismos.

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  17. Bacterial Diversity is Dominant Feature in New Tree of life.
    Elsi Janet García González.
    Este artículo nos habla de la gran diversidad que existe de las bacterias. Dentro del llamado árbol de la vida las bacterias ocupan una gran rama, la más extensa dentro de dicho árbol. Existen secuencias de genoma reconstruidas las cuales fueron identificadas aunque esta bacteria que puede ser la más abundante nunca se ha visto.
    Según Banfield existe una fuerza que ocurre en el genoma ya que las secuencias cuentan con 16 ribosomal los cuales secuencias proteínas.
    Con este árbol de la vida Banfield planta que la gran diversidad de bacteriaso bien de la vida microbiana proveen información para la identificación de las bacterias de temprana vida, así como una compresión de la evolución.
    Se dice que aproximadamente la mitad de las bacterias que están incluidas en la rama de gran tamaño en el nuevo árbol de la vida pertenecen a la Radiación de Filums de Candidato los cuales muestran características de pequeños genomas y otros modos de vivir simbioticos. También los modos de vivir metabólicos pertenecen esta rama cuyos genomas contienen genes compatibles con sus senderos metabólicos que producen ADN y forman proteínas pero a dentro de estos genes existe falta de radiación por lo cual no se completan el ciclo cítrico ácido y cadenas respiratorias por lo cual es probable que ellos puedan fermentar energía metabólica.

    Este artículo muestra la gran diversidad de vida bacterial que existe en la actualidad,lo cual permiten deducir avances dentro de diferentes campos de la ciencia, así como para poder identificar el funcionamiento de ellas gracias a secuencias encontradas.
    Potera C (2016). Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life. Microbe: 11, 7 pp 292 9.

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  18. Camila Monroy Guzmán.


    Bacterial Diversity Is Dominant Feature in New Tree of Life.
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    El artículo básicamente nos habla sobre un árbol de la vida que fue reconstruido usando secuencias de genomas que ilustra cómo las bacterias dominan la diversidad biológica y de su análisis filogenético y cuánto se sabe sobre de diversidad de las bacterias y los genomas de las archeas se realizó en el 16S ribosomal protein (16S rRNA) y describe lo que se sabe de un súper grupo actualmente conocido como Candidate Phyla Radiation.

    Estas investigaciones tienen implicaciones evolutivas como la diversidad funcional de los microbios y los métodos de estudio microbiológico, además de una parte que me parece sumamente interesante en cuestión que es el descubrimiento de los mínimos requerimiento para un sistema vivo, como el de los ancestros de las eucariotas, por ejemplo.

    Entender la vida vida de microbios sido un proceso largo para el desarrollo de la biología, y aunque se han comprendido escalones de la evolución y metabolismos de las formas más simples de vida, nos encontramos lejos de comprender su diversidad y evolución este nuevo árbol es necesario para ver gráficamente la inmensa diversidad de las bacterias y lo que se conoce de la evolución de cada una, sin que sea el final como lo menciona A. Murat en la University of Chicago.

    Candidate Phyla Radiation al menos la mitad de las bacterias presentes en el árbol pertenecen a este supergrupo, que se caracteriza por tener pequeños genomas, del cual no se sabe mucho, ya que sólo un miembro ha sido cultivado. Es importante retomar que tiene genes que contienen reconocibles rutas metabólicas de replicación de DNA y hacen proteínas., para completar el ciclo del ácido cítrico y su capacidad de sintetizar nucleótidos. El descubrimiento de este súper grupo ha sido uno de los mayores "finding that highlights" la descripción del árbol y la plataforma de la vida temprana.

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  19. Cruz Vargas Erick Leonardo.

    El artículo se basa en la interpretación más reciente del árbol de la vida que se reconstruye a base de genomas secuenciados y como es que el tema dominante de éste es que la bacteria se encuentra en el lugar más alto en cuanto a diversidad, además dicho árbol tiene implicaciones para un mejor entendimiento de la evolución, la diversidad funcional de los microbios, requerimientos generales de los sistemas vivos y estudios de la diversidad microbial; Murat dijo que ciertamente no es el "último árbol" si es que hubiese un final, sin embargo, muestra mucha de la diversidad que nos habíamos perdido.
    Así mismo, nos habla también del poco conocimiento que se tiene sobre el metabolismo y estilo de vida de las bacterias "Candidate Phyla Radiation" aún y cuando sus genomas contienen genes reconocibles con vías metabólicas para replicar el DNA, es probable que se basen en la fermentación para la obtención de energía.

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  20. Artículo: Bacterial diversity is dominant feature in new tree of life
    Alumna: Rodríguez Blanco Fernanda
    El artículo nos habla de un nuevo análisis sobre el árbol de la vida. En esta ocasión se tiene al descubierto que dicho árbol incluye al menos 92 nuevos phyla de bacterias, 26 de arqueas y 5 supergrupos de eucariontes.
    Se puede notar que la diversidad del dominio de las bacterias predomina por encima de los otros dos dominios. Por otra parte la gran mayoría de las bacterias más abundantes nunca se han visto; estas sólo han sido identificadas a partir de la reconstrucción de secuencias genómicas.
    El análisis filogenético se basó en el gen 16s rRNA y, se mostró que la ramificación más grande pertenece a las bacterias, mientras que los animales, plantas y hongos pertenecen solamente a dos pequeñas ramificaciones. Este nuevo árbol de la vida proporciona una visión más amplia de lo que realmente se conoce sobre la diversidad filogenética de bacterias y arqueas. El hecho de identificar dicha diversidad incrementa las posibilidades de entender y abrir nuevos caminos hacia el estudio de la evolución y el funcionamiento de estos microorganismos.
    Aproximadamente, una mitad de las bacterias conocidas se incluyen en la rama dominante de “Candidate Phyla Radiation”, el nombre que se le dio al grupo solo es temporal porque la asignación de un nombre formal requiere de más trabajo y así se le podría proporcionar un nombre que realce sus características. Hasta ahora, es muy poco lo que se conoce sobre este nuevo supergrupo pero, no hay duda de que sus genomas son pequeños y tienen un tipo de vida simbiótica.
    El metabolismo que llevan a cabo las bacterias de este supergrupo es escasamente comprendido. Sus genomas contienen genes reconocibles consistentes con sus rutas metabólicas para la replicación de DNA y la realización de proteínas. Sin embargo, las especies que caen dentro de esta característica, carecen de genes para completar el ciclo del ácido cítrico, cadenas respiratorias o la síntesis de nucleótidos. Por lo tanto, es probable que se basen en la fermentación para obtener su energía metabólica y obtengan algunos de sus nutrientes básicos a partir de otros organismos.
    La comprensión total de nuevos microorganismos resulta ser compleja porque a pesar de contar con tecnologías muy sofisticadas, la investigación se poder ver limitada por la enorme variedad de especies presentes, por otro lado esta investigación sirve para futuros análisis en ecología, evolución y bioquímica que proporciona pistas sobre lo que fue el metabolismo en los inicios de la vida.

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  21. Antal Moreno Espinosa

    Una nueva interpretación del árbol de la vida demuestra la total abundancia bacteriana que se ha descubierto recientemente, y de cómo la diversidad de las bacterias es muy grande. El análisis filogenético de este nuevo árbol de la vida se basó en la secuenciación del 16S ribosomal (ARNr). El árbol muestra a los animales, las plantas y los hongos como parte de dos pequeñas ramas, mientras que las bacterias son parte de la rama más grande y vasta. También ha surgido una nueva rama llamada (temporalmente) "Candidate Phyla Radiation", la cual engloba alrededor de la mitad de las bacterias. Sin embargo, se sabe muy poco acerca de estos nuevos microorganismos. Un problema que ha surgido para el estudio óptimo de estos microorganismos es el de no poder cautivarlos o aislarlos, es decir, solamente se pueden estudiar directamente en sus medios naturales.
    El artículo me gustó, ya que habla de la inmensa diversidad que existe en nuestro planeta y de cómo cuando creemos saber un poco sobre algo, nos damos cuenta que en realidad sabemos muy poco.

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  22. Omar Josue Obregón Portugal
    “Diversidad bacteriana, una característica dominante en el nuevo árbol de la vida”
    Este artículo nos habla de la inmensa biodiversidad de las bacterias, una prueba de ello es el nuevo árbol filogenético de la vida, que incluye 92 ramificaciones de bacterias, contra 26 de las arqueas, y tan solo 5 de los denominados súper grupos eucariotas, donde los animales, plantas y hongos se encuentran concentrados en dos ramas pequeñas. Demostrando que en términos de diversidad, las bacterias son las dueñas del mundo, a tal grado que muchas de las bacterias más abundantes de la Tierra ni si quieran se han visto nunca, y solo se logró identificarlas utilizando secuencias de genoma reconstruido.
    Este nuevo árbol de la vida nos permite también tener una mejor comprensión de la evolución, la diversidad funcional de los microbios, los requisitos generales de los sistemas vivos; además de ser precedente de nuevos estudios sobre diversidad bacteriana.
    Otra cosa importante de mencionar es que aproximadamente la mitad de las bacterias que se encuentran a lo largo de la rama dominante, pertenecen a Candidate Phyla Radiation, de la cual poco se sabe acerca de los miembros que la integran, los cuales se caracterizan por tener genomas pequeños y estilos de vida simbióticos. Además de que probablemente utilicen la fermentación como energía metabólica y que derivan algunos de sus bloques de construcción básicos de otros organismos.
    En lo personal este artículo me pareció muy interesante, ya que definitivamente no imaginas la cantidad de diversidad bacteriana, y mucho menos en contraste con la de los eucariontes. Además de que este nuevo árbol de la vida es el comienzo de muchas investigaciones que puedan proporcionar pistas sobre la plataforma metabólica de los primeros años de vida. Y aunque probablemente no sea el último árbol de la vida, nos muestra la cantidad de diversidad que nos hemos perdido a pesar de nuestros notables avances tecnológicos.

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  23. Gracias a recientes análisis genómicos, un grupo de científicos diseñó el nuevo árbol de la vida, el cual clasifica a los seres vivos en 92 phylas de bacteria, 26 de bacteria archea, y 5 macrogrupos eucariota. En esta hipótesis visual se puede apreciar como las bacterias dominan el mundo en términos de diversidad. A pesar de que las bacterias más abundantes no han sido vistas, fueron identificadas usando técnicas de reconstrucción de secuencias genómicas.
    El análisis filogenético se basó en un conjunto de secuencias de proteína ribosomal 16s. Este nuevo árbol de la vida provee un mayor panorama acerca de lo que es sabido sobre la diversidad filogenética de los genomas de archaea y procaria. Tiene implicaciones para un mejor entendimiento de la evolución, la diversidad funcional de los microbios, las bases de varios métodos usados para estudiar la diversidad microbiana, los requerimientos generales de los sistemas vivientes y hacia donde apuntar los futuros estudios sobre diversidad microbiana.
    Alrededor de la mitad de las bacterias organizadas en la rama dominante del nuevo árbol perteneces a la clase “Candidate Phyla Radiation”. Se sabe poco de éstos miembros quienes característicamente tienen genomas pequeños y funcionan simbióticamente. Poco se sabe sobre sus metabolismos, a través del genoma se puede intuir que tienen rutas para la replicación del DNA y hacer proteínas. Sin embargo, las especies que entran en esta categoría carecen de genes para completar el ciclo del ácido cítrico, cadenas respiratorias, y síntesis de nucleótidos. Probablemente dependen de la fermentación para la obtención de energía y nunca han sido aisladas en un laboratorio (con la excepción de TM7).
    A pesar de lo poco que se sabe sobre esta phyla, posteriores análisis en su ecología, evolución y bioquímica pueden proveer pistas para la plataforma metabólica de las primeras formas de vida. A pesar de todo, no deja de ser sorprendente lo poco que conocemos en términos de diversidad, a nuestro planeta.

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    1. Bibliografía extra:
      http://lactobacto.com/tag/candidate-phyla-radiation/

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